dc.contributorSallum, Juliana Maria Ferraz Sallum [UNIFESP]
dc.contributorUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.creatorCosta, Karita Antunes [UNIFESP]
dc.date.accessioned2018-07-30T11:45:02Z
dc.date.accessioned2022-10-07T20:39:53Z
dc.date.available2018-07-30T11:45:02Z
dc.date.available2022-10-07T20:39:53Z
dc.date.created2018-07-30T11:45:02Z
dc.date.issued2016-07-26
dc.identifierCOSTA, Karita Antunes. Genotipagem de pacientes com retinose pigmentar utilizando sequenciamento de nova geração. 2016. 128 f. Tese (Doutorado) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2016.
dc.identifierhttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/47721
dc.identifier2016-0831.pdf
dc.identifier.urihttp://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/4020833
dc.description.abstractRetinitis pigmentosa is a group of diseases characterized clinically by loss of peripheral visual field, and night blindness can be caused by mutations in several genes. Purpose: Determine, for each of the 16 patients, the molecular basis of RP by the analysis of 132 genes related dystrophies Retina. Methods: 16 patients with the clinical diagnosis of retinitis pigmentosa, which could have an autosomal dominant cause, were included. DNA was extracted from peripheral blood. Specific primers were designed to be used in NGS Illumina platform. Sequencing was performed according to the Illumina protocol. The NGS strategy was to identify mutations. genomic variations were analyzed by predictions programs and databases such as the National Center for Biotechnology Information (NCBI) Gene Cards, Human Gene Mutation Data (HGMD) Mutation Taster and Polyphen 2. Results: Nine patients had positive or probably positive. The term "probably positive" have been used when the change is predicted as pathogenic, but there are no reports in the literature consulted. Six patients had inconclusive results and a negative result. Information on the variations were analyzed in different databases. Conclusion: NGS was an effective tool for molecular genotyping of individuals with diseases of high genetic heterogeneity as Retinitis Pigmentosa.
dc.description.abstractRetinose pigmentar é um grupo de doenças caracterizadas clinicamente por perda de campo visual periférico, cegueira noturna e pode ser causada por mutações em vários genes. Objetivo: Determinar, para cada um dos 16 pacientes, a base molecular da RP pela análise de 132 genes relacionados à Distrofias de Retina. Métodos: 16 pacientes com o diagnóstico clínico de Retinose Pigmentar, que poderia ter causa autossômica dominante, foram incluídos. O DNA foi extraído do sangue periférico. Primers específicos foram desenhados para serem usados no NGS da plataforma Illumina. O sequenciamento foi realizado de acordo com o protocolo da Illumina. A estratégia NGS foi aplicada para identificar as mutações. Variações genômicas foram analisada por programas de predições e bancos de dados como o National Center for Biotechnology Information (NCBI), Gene Cards, Human Gene Mutation Data (HGMD), Mutation Taster e Polyphen 2. Resultados: Nove pacientes tiveram resultados positivos ou provavelmente positivos. O termo "provavelmente positivo" foi utilizado quando a variação é predita como patogênica, mas não há relatos nas literaturas consultadas. Seis pacientes obtiveram resultados inconclusivos e um resultado negativo. As informações sobre as variações foram analisadas em diferentes bancos de dados. Conclusão: NGS foi uma ferramenta molecular eficiente para genotipagem de indivíduos com doenças de heterogeneidade genética elevada como a Retinose Pigmentar.
dc.languagepor
dc.publisherUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.rightsAcesso restrito
dc.subjectretinal genetic diseases
dc.subjectpigmentary retinosis
dc.subjectmolecular genetic diagnosis
dc.subjectdna
dc.subjectgenetic sequencing
dc.subjectnew generation sequencing
dc.subjectretinal dystrophies
dc.subjectdoenças genéticas da retina
dc.subjectretinose pigmentar
dc.subjectdiagnóstico genético molecular
dc.subjectdna
dc.subjectsequenciamento genético
dc.subjectsequenciamento de nova geração
dc.subjectdistrofias de retina
dc.titleGenotipagem de pacientes com retinose pigmentar utilizando sequenciamento de nova geração
dc.typeTese de doutorado


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