bachelorThesis
Endofíticos em Eucalipto: indução in vitro e mineração de dados moleculares
Registro en:
2011043108
SANTOS, Aline Beatriz Ribeiro dos. Endofíticos em Eucalipto: indução in vitro e mineração de dados moleculares. 2019. 30 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) – Centro de Biociências. Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2019.
Autor
Santos, Aline Beatriz Ribeiro dos
Resumen
Endophytes are fungi or bacteria that live embedded in the plant tissues of virtually every plant and that perform various functions in this condition in addition to ensuring their survival. These microorganisms are of great importance also for plants and aspects regarding nutrition or even conferring defense. In some less frequent situations they may be pathogenic. In this work, we tried to approach the endophytic theme with two basic objectives in eucalyptus plants. The first objective was to create the conditions to induce the growth of these organisms in vitro in the laboratory and the second was to search for scientific articles that allowed the mining of molecular data on the main existing species. The methodology of this work consisted of decontaminating discs of leaves of eucalyptus species cultivated in TECHS (Tolerância de Eucalyptus Clonais aos Estresses Hídrico, Térmico e Biótico/ EAJ-Escola Agrícola de Jundiaí/UFRN) and inducing their growth in in vitro culture media. Mining of molecular data was done by searching for articles in the PUBMED database followed by identification of nucleotide sequences for each type of organism cited in the articles. The results showed that it was possible to induce microorganisms in vitro by defining the leaf surface disinfestation protocol. The collection of references and DNA sequences resulted in 27 scientific articles on eucalyptus endophytes. From these references and consulted public databases, 306 genomes, 4,182,587 nucleotide sequences and 618,716 genes in endophytic organisms related to the eucalyptus plant were identified. Endofíticos são fungos ou bactérias que vivem inseridos nos tecidos vegetais de praticamente todos as plantas e que exercem várias funções nesta condição além de garantir sua sobrevivência. Estes microrganismos são de grande importância também para as plantas e aspectos quanto a nutrição ou mesmo conferindo defesa. Em algumas situações menos frequentes podem ser patogênicos. Neste trabalho, procurou-se abordar a temática dos endofíticos com dois objetivos básicos em plantas de eucalipto. O primeiro objetivo foi criar as condições para induzir in vitro o crescimento desses organismos em laboratório e o segundo consistiu na busca de artigos científicos que permitissem a mineração de dados moleculares sobres as principais espécies existentes. A metodologia do trabalho consistiu então em descontaminar discos de folhas de espécies de eucalipto cultivadas no experimento TECHS (Tolerância de Eucalyptus Clonais aos Estresses Hídrico, Térmico e Biótico) da EAJ-Escola Agrícola de Jundiaí/UFRN, e induzir seu crescimento em meios de cultura in vitro. A mineração de dados moleculares foi feita através da busca de artigos na base de dados PUBMED seguida da identificação de sequencias nucleotídicas para cada tipo de organismo citado nos artigos. Os resultados obtidos mostraram que foi possível a indução dos microrganismos in vitro definindo o protocolo de desinfestação da superfície das folhas. O levantamento de referências e de sequencias de DNA resultou em 27 artigos científicos sobre endofíticos em eucalipto. A partir destas referências e consultados bancos de dados públicos foram identificados 306 genomas, 4.182.587 nucleotídeos sequenciados e 618.716 genes em organismos endofíticos relacionados com a planta do eucalipto.