Sertraline is an antidepressant drug used for the treatment of depressive disorders that are able to diminish male fertility by decreasing the sperm cell numbers in the ejaculate. However, the mechanism related to these effects is still not unknown. Moreover, it is reported that epididymis contractions could be altered by different drugs, affecting the number of sperm cells and leading to impairment of male fertility. Then, this study aimed to investigate if sertraline could affect the epididymis contraction, altering the sperm transit and/or sperm number in different parts of epididymis. In vitro effects of sertraline (1, 3 and 10 μM) were evaluated in isolated distal cauda epididymis mounted in an organ bath set up. The long-term treatment with sertraline (20 mg.Kg-1,i.p.) for 21 days were also evaluated on distal cauda epididymis contractions, serum testosterone levels and sperm parameters. In vitro sertraline > 3 μM decreased the contractions of distal cauda epididymis induced by KCl, phenylephrine or carbachol. In addition, the long-term in vivo treatment with sertraline promoted an enhancement of distal cauda spontaneous contractions and a potentiation of adrenergic agonist-induced contractions. Thus, we also found that in vivo sertraline treatments decreased the serum testosterone level, diminished daily sperm production, sperm reserves trough epididymis and sperm transit time in cauda epididymis. Altogether, our results indicated that sertraline is able to alter the motor activity of epididymis which could be associated to the low sperm count in this organ and accelerated transit time trough epididymal cauda found in treated animals.A sertralina é um inibidor seletivo da recaptação de serotonina utilizado no tratamento da depressão que é capaz de reduzir a fertildiade masculina por mecanismos não conhecidos. O presente estudo foi realizado com o objetivo de investigar se o epididimo poderia estar associado aos efeitos anti-fertilidade da sertralina. Foram avaliados os efeitos in vitro da sertralina (1, 3 e 10 μM) em experimentos funcionais utilizando segmentos da cauda distal do epidídimo de rato. Os efeitos do tratamento in vivo por 21 dias com sertralina (20 mg.Kg-1, i.p.) foram também avaliados sobre as contrações na cauda distal do epidídimo, níveis séricos de testosterona e parâmetros espermáticos (produção diária, numero de espermatozoides e transito epidimário). A sertralina > 3 μM prejudicou as contrações da cauda distal do epididimo de rato induzidas por KCl, fenilefrina ou carbacol. O tratamento in vivo com sertralina por 21 dias promoveu: (a) um aumento das contrações espontâneas da cauda distal do epidídimo; (b) um aumento da potência das contrações induzidas pelo agonista adrenérgico fenilefrina; (c) diminuição dos níveis séricos de testosterona; e (d) uma diminuição na produção diária de espermatozóides, na quantidade de espermatozoides na cabeça/corpo e cauda do epidídimo e uma aceleração do tempo de trânsito espermático na cauda do epidídimo. Em conclusão, nosso dados sugerem que o epididimo pode ser um alvo dos efeitos antifertilidade da sertralina uma vez que tal fármaco foi capaz de alterar a atividade motora do epidídimo, induzindo uma redução na contagem de espermatozoides nesse órgão e no tempo de trânsito espermático na cauda do epidídimo.