Estudo de viroma em água de esgoto influente e efluente na estação de tratamento de esgoto norte em Brasília

Abstract

A contaminação por patógenos humanos na água de esgoto é um assunto importante, principalmente em locais onde as condições de saneamento não são ideais. A tecnologia de Next Generation Sequencing (NGS) tem sido utilizada em diversos estudos metagenômicos virais (viromas). Além de descrever a diversidade genética, é uma ferramenta útil para analisar o viroma em amostras de esgoto. Apesar do interesse no tratamento de água, a cidade de Brasília não possuí um estudo de censo e informações focado na contaminação viral do Lago Paranoá. Com este propósito, os patógenos humanos astrovírus (HAstV), norovírus (NoV) e sapovírus (SaV) foram selecionados e investigados em amostras de água não-tratada (influente) e tratada (efluente) utilizando o NGS. Amostras de influente e efluente (de março, maio de 2016 e fevereiro de 2017) foram coletadas na estação de tratamento de água de esgoto em Brasília, Brasil. As amostras foram submetidas a processos de extração de RNA e as bibliotecas de cDNA foram sequenciadas através do Illumina HiSeq 2000, com a condição de 100 bases paired-end. Os reads foram trimados através do Trimmomatic e os contigs foram montados com os programas Megahit e Velvet. As sequências foram analisadas por tBLASTX e Megablast, respectivamente, contra o "RefSeq Virus" utilizando o software Geneious v.8.1. Os reads resultantes também foram enviados e analisados na plataforma online Kaiju. Os SaV foram detectados nas seis amostras sequenciadas, HAstV e NoV foram encontrados em todas as amostras, exceto no efluente de maio. Os resultados encontrados foram discutidos e comparados com estudos brasileiros e internacionais.