Computational analysis, production and purification of OmpG and OmpN as two novel protein candidates for cell membrane translocation

Abstract

The results obtained with the OmpA as a protein that can be translocated in cell membrane has caused interest in identifying if there are other proteins that could be translocated in a more efficient way. In this study two outer membrane proteins (OmpG and OmpN) were analyzed in silico to identify if one of they could be a proper candidate for being translocated in the membrane. Computational analysis of both proteins pointed out that they have physicochemical properties that make them proper candidates for being translocated in cell membrane as high levels of hydrophobicity and the charge surface. Therefore, they were produced and purified by affinity between a histidine tag and an immobilized metal in magnetic beads. Finally, the results indicate that OmpN could be the protein that might be more suited for future biomedical applications of the porins

"Los resultados obtenidos con la OmpA como proteína que puede ser translocada en la membrana celular ha despertado el interés de identificar si existen otras proteínas que puedan ser translocadas de manera eficiente. En este estudio se analizaron dos proteínas de la membrana externa (OmpG y OmpN) por medio de un estudio in silico, para identificar si son candidatas que permitan pensar ser cargadas con el fin de liberar moléculas al interior de la célula de manera controlada. El análisis computacional permitió concluir que ambas proteínas,tienen propiedades físico-químicas que las convierten en candidatas adecuadas para ser translocadas en la membrana celular, tales como altos índices de hidrofobicidad junto a una superficie de carga que permite su adecuada interacción con el solvente y región hidrofílica de la célula. Por lo tanto, ambas proteínas fueron producidas y purificadas por medio de cromatografía de afinidad. Los resultados indican que la OmpN podría ser la proteína más adecuada para las futuras aplicaciones biomédicas debido a sus propiedades fisicoquímicas y a la cantidad de proteína que puede ser recuperada de su respectivo cultivo."--Tomado del Formato de Documento de Grado