Trabajo de grado - Maestría
Identificación de Arbovirus circulantes en una cohorte de pacientes con síndrome febril en el municipio de Villa del Rosario, Norte de Santander
Autor
Carrillo Hernández, Marlen Yelitza
Institución
Resumen
Los Virus Dengue (DENV), el Virus del Chikungunya (CHIKV) y el Virus Zika (ZIKV) son trasmitidos por el mismo vector, lo que resulta en la co-circulación de estos
tres virus en las mismas regiones geográficas, aumentando la posibilidad de coinfecciones.
El objetivo de este estudio fue identificar las cepas circulantes y calcular la
prevalencia de co-infecciones en el municipio Villa del Rosario (Norte de Santander). Para
lograr esto, con previo aval de bioética y consentimiento informado, se recolectaron
muestras de suero de pacientes que presentaban fiebre menor de 7 días y con diagnóstico
clínico compatible con alguna de estas tres enfermedades virales. Se extrajo el ARN de
los sueros, posteriormente se realizó la retrotranscripción (RT) para obtener el cDNA, el
cual fue utilizado como plantilla para la identificación de DENV y CHIKV (por PCR
convencional) y ZIKV (por Real Time PCR). Las muestras positivas para DENV fueron
serotipificadas y algunas muestras positivas para DENV y CHIKV fueron secuenciadas.
Los resultados demostraron que 82 pacientes fueron positivos para uno o más virus: 33
(21.02%) para DENV, 47 (29.94%) para CHIKV y 29 (18.47%) para ZIKV.
Adicionalmente, se encontró co-infección entre ellos: la prevalencia de co-infección
DENV/CHIKV, DENV/ZIKV y CHIKV/ZIKV fue del 7.64%, 6.37% y 5.10%, con tasas
de ataque de 14.90, 12.42 y 9.93 casos por cada 100.000 habitantes, respectivamente. Por
otro lado, se encontraron tres pacientes co-infectados con los tres virus (prevalencia del
1.91%) con una tasa de ataque de 4.96 casos por 100.000 habitantes. Este estudio
demuestra la simultánea co-circulación de DENV, CHIKV y ZIKV y sus co-infecciones
en la región nororiente de Colombia. Dengue virus (DENV), Chikungunya virus (CHIKV) and Zika virus (ZIKV) are
transmitted by the same vector, resulting in the co-circulation of these three viruses in the
same geographic regions, increasing the possibility of co-infections. The objective of this
study was to identify circulating strains and estimate the prevalence of co-infections in the
municipality of Villa del Rosario (Norte de Santander). To achieve this, prior endorsement
of bioethics and informed consent, serum samples from patients with fever less than 7
days and with clinical diagnosis compatible with any of these three viral diseases were
collected. RNA was extracted from sera subsequently reverse transcription (RT) was
performed to obtain cDNA, which was used as a template for identifying DENV and
CHIKV (conventional PCR) and ZIKV (real-time PCR). DENV-positive samples were
serotyped, and some of those positive for DENV and CHIKV were sequenced. The results
showed that eighty-two patients were positive for one or more viruses: 33 (21.02%) for
DENV, 47 (29.94%) for CHIKV and 29 (18.47%) for ZIKV. In addition, co-infection
among them was found: the prevalence of DENV/CHIKV, DENV/ZIKV, and
CHIKV/ZIKV co-infection was 7.64%, 6.37%, and 5.10%, with attack rates of 14.90,
12.42, and 9.93 cases per 100,000 inhabitants, respectively. Furthermore, three patients
were found to be co-infected with all three viruses (prevalence of 1.91%), with an attack
rate of 4.96 cases per 100,000 inhabitants. Our results demonstrate the simultaneous cocirculation
of DENV, CHIKV, ZIKV and their co-infections in the northeastern region of
Colombia.