Phylogenetic hypotheses of octocoral species using predicted RNA secondary structures of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) = - Hipótesis filogenética de especies de octocorales utilizando estructuras secundarias del espaciador interno transcrito 2 (ITS 2)

Abstract

Octocoral systematics is a relatively new field of study. Morphological aspects together with molecular identification are tools that have been recently applied to solve systematic questions in octocorals due to their intricate morphology. For this group, as for many others, the use of a molecular marker that solves systematic problems at different taxonomic levels would be extremely useful for species identification and classification. Here we use the internal transcribed spacer 2 (ITS2) predicted RNA secondary structure for reconstructing phylogenetic hypotheses at different taxonomic levels. These structures are very important for the ribosome assembly since they are involved in mRNA folding and processing. For this reason, mutations that do not enable the proper folding of the sequence have to be compensated or suppressed. Hence, ITS2 are said to evolve in concert, which leads to a homogenization of all the copies of this gene throughout the genome...

Debido a su compleja morfología la sistemática de octocorales es una nueva área de estudio; recientemente han sido aplicadas herramientas como identificación molecular, junto con aspectos morfológicos, para resolver preguntas sobre la sistemática de los octocorales. Para este grupo, como para muchos otros, se podría utilizar marcadores moleculares para resolver problemas sistemáticos a diferentes niveles taxonómicos, estos serían de gran ayuda para la identificación y clasificación de especies. En este estudio se utilizó el modelo de estructura secundaria del espaciador interno transcrito 2 (ITS2) del ARN para construir filogenéticas a diferentes niveles taxonómicos. Estas estructuras son muy importantes para el ensamblaje de ribosomas, ya que están involucradas en el pliegue y procesamiento correcto del ARNm. Por esta razón, mutaciones que no permitan la adecuada formación de estas estructuras serán compensadas o eliminadas. Como consecuencia de lo anterior se ha propuesto que el ITS2 evoluciona en concierto, lo que lleva a una homogenización de todas las copias de este gen en el genoma...