Se analizaron los niveles de metales pesados, metalotioninas y tasa de crecimiento (ARN/ADN) en ejemplares hembras del bivalvo Lima scabra en las localidades de La Crucita y Las Minas en la Isla de Cubagua, estado Nueva Esparta. La localidad de Las Minas está caracterizada por la presencia visible de escapes de gas e hidrocarburos mientras que, la segunda zona (La Crucita), se encuentra visiblemente libre de dicha actividad. Los ejemplares de Lima scabra fueron colectados manualmente a profundidades de 2 a 3 m, con tallas que oscilaron entre 4 a 10 cm de longitud. Los niveles de metales pesados se determinaron utilizando espectrofotometría de absorción atómica. Se evaluaron las concentraciones de cromo (Cr), hierro (Fe), níquel (Ní), plomo (Pb) y cadmio (Cd) en sedimentos y en los tejidos: hepatopáncreas (H), músculo (M), branquias (B), manto (Ma) y resto (R) (μg/g peso seco) por espectrofotometría de absorción atómica, utilizando material de referencia certificado. Las metalotioninas (Mts) fueron cuantificadas en todos los tejidos y la relación (ARN/ADN), en el músculo abductor del bivalvo Lima scabra. Los datos para metales, Mts y relación ARN/ADN, fueron analizados estadísticamente por el test de Kruskal Wallis. En los sedimentos, se observaron diferencias estadísticamente significativas para todos los metales analizados (Cr, Fe, Ní, Pb y Cd) en ambas localidades (P< 0,001), encontrándose en el análisis de metales totales para los tejidos, diferencias significativas para Cr (Kw= 10,874; P< 0,001) y Cd (Kw= 24,408; P< 0,001); siendo la concentración de Cr mayor en Las Minas y la de Cd mayor en La Crucita. Las concentraciones de Mts totales, no mostraron variaciones significativas (P> 0,05) entre las dos localidades, aunque con respecto a los tejidos, se presentaron diferencias en la Crucita (P= 0,001), con un máximo promedio en el R y en Las Minas (P< 0,001) con un máximo en el R, mientras que para la relación ARN/ADN, los resultados muestran que en este estudio no se evidenciaron diferencias significativas, lo cual sugiere que la condición fisiológica del organismo es similar en ambas localidades y no es afectada por la presencia de metales.