Detección de polimorfismos en la región codificante del gen receptor de hormona luteinizante mediante análisis de polimorfismo conformacional de cadena simple y secuenciación en bovinos Carora

Detection of polymorphisms within the coding region of luteinizing hormone receptor gene by single-strand conformation polymorphism analysis and sequencing in Carora cattle

dc.creatorVásquez Marín, Belkys Josefina
dc.creatorMárques Urdaneta, Alexis Feliciano
dc.creatorSeijas Pedroza, Geomar
dc.creatorDe La Rosa, Oscar
dc.creatorAranguren Méndez, José Atilio
dc.date2014-10-31T16:30:51Z
dc.date2014-10-31T16:30:51Z
dc.date2014-10-31T16:30:51Z
dc.date.accessioned2017-03-03T14:43:38Z
dc.date.available2017-03-03T14:43:38Z
dc.identifier0798-2259
dc.identifierhttp://www.saber.ula.ve/handle/123456789/39223
dc.identifier199102ZU46
dc.identifier.urihttp://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/221419
dc.descriptionCon el objeto de caracterizar los polimorfismos nucleotídicos simples (SNP) presentes en una región del exón 11 del gen receptor de hormona luteinizante en bovinos Carora, se analizaron 98 muestras de ADN bovino pertenecientes al banco de ADN del laboratorio de Biotecnología Agrícola de la Escuela Socialista de Agricultura Tropical (ESAT). El ADN se extrajo mediante una metodología de precipitación salina. Las secuencias variantes fueron evidenciadas en primera instancia por amplificación del segmento de interés y análisis de polimorfismo conformacional de cadena simple (PCR-SSCP). Se detectaron cuatro patrones electroforéticos en el fragmento estudiado. Luego, 19 muestras representativas de cada uno de los patrones fueron amplificadas y enviadas a un servicio de secuenciación capilar estándar (Macrogen, Inc., Corea). Se detectaron dos variantes en el fragmento de ADN evaluado: rs41256848 (1410G>T) detectada previamente y una variante nueva (1337C>T). Se detectaron dos alelos (G y T) y tres genotipos (GG, GT, TT) para la variante rs41256848; y dos alelos (C y T) y dos genotipos (CC, CT) para la variante nueva. Las frecuencias alélicas para la variante rs41256848 fueron 0,852 – 0,147 para G y T, respectivamente; mientras que para la nueva variante fueron 0,964 – 0,035 para C y T, respectivamente. Las frecuencias genotípicas para rs41256848 fueron 0,7551 – 0,1938 – 0,0510 para GG, GT, TT, respectivamente; para la variante nueva fueron 0,9285 – 0,0071 para CC, CT, respectivamente. La muestra poblacional estudiada no se encuentra en equilibrio de Hardy-Weinberg para la variante rs41256848. Los resultados obtenidos en la presente investigación demostraron la presencia de polimorfismos en el fragmento de LHR estudiado, en animales Carora.
dc.description428 - 435
dc.descriptionbelkysvasquez68@gmail.com
dc.descriptionIn order to characterize the simple nucleotide polymorphisms (SNPs) within of exon 11 of the luteinizing hormone receptor gene in Carora cattle, 98 bovine DNA samples belonging to the DNA Bank Agricultural Biotechnology Laboratory of the Socialist School Tropical Agriculture (ESAT) were analyzed. The DNA is extracted by salting-out methodology. The variants sequences were evidenced by amplification of the segment and single strand conformation polymorphism analysis (PCR-SSCP). Four electrophoretic patterns were detected in the studied fragment. Then, 19 representative samples of each of the patterns, were amplified and sent to a standard capillary sequencing service (Macrogen, Inc., Korea). Two variants were detected in the DNA fragment evaluated: rs41256848 (1410G> T) previously detected and a new variant (1337C> T). Two alleles (G and T) and three genotypes (GG, GT, TT) for variant rs41256848 detected; and two alleles (C and T) and two genotypes (CC, CT) for the new variant. The allele frequencies for rs41256848 variant were 0.852 - 0.147 for G and T, respectively; while for the new variant was 0.964 - 0.035 for C and T, respectively. The genotype frequencies for rs41256848 were 0.7551 - 0.1938 - 0.0510 for GG, GT, TT, respectively; for the new variant were from 0.9285-o 0.0071 for CC, CT, respectively. The studied sample population is not in Hardy-Weinberg equilibrium for the rs41256848 variant. The results obtained in this investigation showed the presence of polymorphisms in the LHR fragment studied in Carora animals.
dc.languagees
dc.publisherVenezuela
dc.subjectPolimorfismo
dc.subjectADN
dc.subjectSNP
dc.subjectSSCP
dc.subjectHormona
dc.subjectBovino
dc.subjectUniversidad del Zulia (LUZ)
dc.subjectUniversidad de Los Andes (ULA)
dc.subjectPolymorphism
dc.subjectDNA
dc.subjectHormone
dc.subjectBovine
dc.subjectRevista Científica: Producción Animal
dc.subjectRevista Científica
dc.subjectMedio Ambiente
dc.subjectRevistas
dc.titleDetección de polimorfismos en la región codificante del gen receptor de hormona luteinizante mediante análisis de polimorfismo conformacional de cadena simple y secuenciación en bovinos Carora
dc.titleDetection of polymorphisms within the coding region of luteinizing hormone receptor gene by single-strand conformation polymorphism analysis and sequencing in Carora cattle
dc.typeArtículos de revistas


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