Detecção de marcadores moleculares plastidiais para estudos filogenéticos e cpssrs específicos para orquídeas sapatinhos-de-vênus (Cypripedioideae, Orchidaceae)

dc.contributorSantos, Marisa
dc.contributorBakker, Freek T.
dc.contributorGravendeel, Barbara
dc.contributorVoos, Rutger
dc.contributorUniversidade Federal de Santa Catarina
dc.creatorThiesen, Julia Faillace
dc.date2017-04-13T19:01:12Z
dc.date2017-04-13T19:01:12Z
dc.date2015-11-19
dc.date.accessioned2018-10-31T21:01:56Z
dc.date.available2018-10-31T21:01:56Z
dc.identifierhttps://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/174843
dc.identifier.urihttp://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/1789011
dc.descriptionTCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.
dc.descriptionApesar dos recentes avanços em genética de populações e filogenética de orquídeas, a demanda por novos marcadores moleculares ainda é alta. Orquídeas sapatinhos-de-vênus (Cypripedioideae) são exemplo de um grupo em que os atuais marcadores moleculares são insuficientes para distinguir espécies que divergiram recentemente e especificar identidade taxonômica e origem de material ilegalmente comercializado. No presente estudo, têve-se como objetivo obter o máximo de sequências do genoma do cloroplasto (cpDNA) de espécimes de orquídeas, possibilitando a detecção de novos marcadores moleculares para a subfamília. Foram processados dados de sequenciamento genômico de três orquídeas sapatinhos-de-vênus: Cypripedium calceolus, Phragmipedium longifolium e Paphiopedilum barbatum. As amostras foram previamente sequenciadas por autores distintos, utilizando-se de três técnicas diferentes, Illumina HiSeq 2000 e Roche 454 Next Generation Sequencing (NGS) e Sanger First Generation Sequencing (FGS). Material vegetal fresco e de herbário foram utilizados. A montagem do genoma do cloroplasto (cpDNA) foi realizada com o uso de diferentes pipelines de bioinformática, destacando-se o software Iterative Organelle Genome Assembly (IOGA). Sequências do cpDNA de material vegetal fresco e de herbário foram obtidas e análise comparativa foi realizada. Um total de 29 marcadores filogenéticos e 54 marcadores de genética de populações foram detectados. Os métodos de sequenciamento genômico e de bioinformática utilizados neste trabalho fornecem novo escopo para rápida detecção de novos marcadores moleculares a baixos custos, tanto para material fresco como de herbário.
dc.format111 p.
dc.formatapplication/pdf
dc.languagept_BR
dc.publisherFlorianópolis, SC.
dc.subjectPaphiopedilum
dc.subjectplastoma
dc.subjectPhragmipedium
dc.subjectCypripedium
dc.subjectDNA histórico
dc.titleDetecção de marcadores moleculares plastidiais para estudos filogenéticos e cpssrs específicos para orquídeas sapatinhos-de-vênus (Cypripedioideae, Orchidaceae)
dc.typeTesis


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