Hepatitis B virus genotyping among chronic hepatitis B patients with resistance to treatment with lamivudine in the City of Ribeirão Preto, State of São Paulo

Abstract

INTRODUCTION: Lamivudine is a nucleoside analogue that is used clinically for treating chronic hepatitis B infection. However, the main problem with prolonged use of lamivudine is the development of viral resistance to the treatment. Mutations in the YMDD motif of the hepatitis B virus DNA polymerase gene have been associated with resistance to drug therapy. So far, there have not been many studies in Brazil reporting on genotype-dependent development of resistance to lamivudine. Thus, the aim of the present study was to determine the possible correlation between a certain genotype and increased development of resistance to lamivudine among chronic hepatitis B patients. METHODS: HBV DNA in samples from 50 patients under lamivudine treatment was amplified by means of conventional PCR. Samples were collected at Hospital das Clínicas, FMRP-USP. The products were then sequenced and phylogenetic analysis was performed. RESULTS: Phylogenetic analysis revealed that 29 (58%) patients were infected with genotype D, 20 (40%) with genotype A and one (2%) with genotype F. Mutations in the YMDD motif occurred in 20% of the patients with genotype A and 27.6% of the patients with genotype D. CONCLUSIONS: Despite the small number of samples, our results indicated that mutations in the YMDD motif were 1.38 times more frequent in genotype D than in genotype A.

INTRODUÇÃO: Lamivudina é um análogo de nucleosídeo clinicamente utilizado para o tratamento da infecção crônica pela hepatite B. Entretanto, o principal problema do uso prolongado da lamivudina é o desenvolvimento de resistência viral ao tratamento. Mutações no motivo YMDD no gene da DNA polimerase do vírus da hepatite B estão associados com a resistência a terapia medicamentosa. Até o presente momento, não há muitos estudos no Brasil que descrevem o desenvolvimento genótipo-dependente da resistência à lamivudina. Assim, o intuito do trabalho aqui descrito foi determinar a possível correlação entre um determinado genótipo e o desenvolvimento aumentado da resistência à lamivudina em pacientes com hepatite B crônica. MÉTODOS: O HBV DNA foi amplificado por PCR convencional a partir de 50 amostras coletadas de pacientes submetidos ao tratamento com lamivudina no Hospital das Clínicas- FMRP- USP. Posteriormente, os produtos foram seqüenciados e a análise filogenética foi realizada. RESULTADOS: A análise filogenética mostrou que 29 (58%) pacientes foram infectados com o genótipo D, 20 (40%) com o genótipo A e 1 (2%) com o genótipo F. Mutações no motivo YMDD ocorreu em 20% dos pacientes com genótipo A e 27,6% em pacientes do genótipo D. CONCLUSÕES: Apesar do baixo número de amostras, nossos resultados indicaram que mutações no motivo YMDD são 1,38 X mais frequentes no genótipo D em relação ao genótipo A.