Estudo da diversidade genética de Podosphaera xanthii através de marcadores AFLP e seqüências ITS

Abstract

O meloeiro (Cucumis melo L.) é uma frutífera largamente cultivada no Brasil, principalmente no nordeste brasileiro, onde é produzida principalmente para a exportação. Plantas da família do meloeiro, como pepino e abóbora, podem ser severamente afetadas pelo oídio, causado por Podosphaera xanthii.. Este fungo apresenta diversas raças fisiológicas cuja correta identificação é importante para o manejo da doença, já que o uso de variedades resistentes é o método mais eficaz de seu controle. No entanto, a identificação destas raças por meio da prática tradicional de inoculações em uma série diferenciadora de variedades de meloeiro é laboriosa e passível de erros. Devido a isso, um método alternativo seria o uso de marcadores moleculares para determinar de forma rápida a identidade das raças. O objetivo deste estudo foi o de analisar a variabilidade entre isolados de P. xanthii previamente classificados em raças através da técnica de AFLP e do seqüenciamento da região ITS 5.8S do rDNA. A partir dos marcadores AFLP obteve-se um dendrograma no qual não houve separação dos isolados quanto às suas raças, origem geográfica ou hospedeiro de origem. Com esta técnica verificou-se alta variabilidade entre isolados, com similaridade genética máxima de 69% e similaridade mínima de 23%. Ao contrário da informação gerada por AFLP, não foi observada variação na sequência da região ITS 5.8S entre isolados. Desta forma, a análise por AFLP indicou que os isolados tem composição genética heterogênea muito embora este fato não tenha sido evidenciado pelo sequenciamento da região ITS.

Melon crop (Cucumis melo L.) is a fruit largely cultivated in Brazil, especially in the Northwestern region, where it is produced mainly for export. Plants of the melon family, such as cucumber and pumpkin, can be severely affected by powdery mildew, caused by Podosphaera xanthii. This fungus has several physiological races and their correct identification is important for managing the disease, since the use of resistant cultivars is the most effective method for its control. However, identification of races by the traditional method of inoculation in a differential series of melon varieties is laborious and error prone. Due to this, an alternative method would be the use of molecular markers to quickly determine the race identity. The objective of this study was to analyze the variability among P. xanthii isolates previously classified into races through the AFLP technique and sequencing of the rDNA's ITS 5.8S region. With the AFLP markers a dendrogram was generated, where the isolates could not be grouped according to their races, geographic region or host. With this technique, a high variability among isolates was verified, with maximum genetic similarity of 69% and minimum similarity of 23%. In contrast to the AFLP data, there was no sequence variation in the ITS 5.8S region among isolates. Thus the AFLP data indicated that the isolates have a heterogeneous genetic composition even though this was not evidenced by the sequencing of the ITS region.