dc.identifier | Kelle de Araújo Barbosa, Pedranne; Maria Benko Iseppon, Ana. Interações bióticas e abióticas em feijão- caupi (Vigna unguiculata) pela técnica de SAGE (Serial Analysis of Gene Expression). 2010. Tese (Doutorado). Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas, Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2010. | |
dc.description | Danos provocados por estresses bióticos e/ou abióticos são fatores limitantes na
produção do feijão-caupi (Vigna unguiculata), favorecendo a redução no crescimento e
na produtividade desta cultura. Uma alternativa a estes fatores limitantes é o uso de
cultivares com características genéticas competitivas e eficientes contribuindo para
alcançar um padrão de agricultura mais sustentável e com melhores condições de
produção. Assim, pesquisas que possibilitem compreender funções específicas de genes
preditos de plantas e seus perfis de expressão em resposta a uma dada condição, são de
extrema importância. Com base nisso, uma das metas do projeto NordEST
(http://www.vigna.ufpe.br) consistiu na análise funcional de genes de feijão-caupi
associados a estes tipos de estresses. Neste âmbito, o presente trabalho teve como
objetivo analisar o perfil de expressão diferencial de genes através da técnica de
SuperSAGE a partir de transcritos de folhas de feijão-caupi submetidas a injúria
mecânica (biblioteca C2) e ao estresse causado pelo vírus do mosaico severo do feijãocaupi
(CPSMV) (biblioteca BRM), com o intuito de obter um melhor entendimento com
relação à resposta específica a este tipo de estresse, comparativamente a um controle
negativo (ausência de injúria; biblioteca C1). As tags que apresentaram 100% de
identidade com sequências de EST do banco privado de Vigna (banco NordEST), foram
analisadas quanto à sua expressão diferencial e os transcritos que tiveram seus genes
superexpressados e/ou reprimidos, dentro dos parâmetros requeridos (escore ≥42)
foram anotados em categorias funcionais, de acordo com os termos de ontologia gênica
(Gene Ontology) relativos a processos biológicos, função molecular e componente
celular. Os resultados demonstraram que muitas sequências, tanto das bibliotecas
submetidas à injúria, quanto as bibliotecas inoculadas com CPSMV estão relacionadas à
categorias associadas a estresse, seguido de categorias relacionadas ao processos de
tradução, ligação de proteínas, regulação da transcrição, redução de oxidação,
transporte, proteólise, entre outros. Estas categorias estão relacionadas a rotas
metabólicas importantes na resposta a estresses bióticos, indicando que estas tags
representam um potencial real para descobertas de novos genes responsivos à injúria
ou à resistência ao CPSMV, talvez ainda não descritos e/ou caracterizados | |