El agua de la subcuenca del Río Túnico como expresión del uso de los suelos debe monitorearse a fin de garantizar las sostenibilidad de los ecosistemas agropecuarios a través de la conservación de las fuentes hídricas. Basado en la zonificación del uso actual de la subcuenca y las lecturas mensuales de parámetros físico-químicos realizados entre julio 2012 a junio 2013 se determinó la calidad del agua del Río Túnico como respuestas al uso del suelo mediante regresión logística, utilizando como valores máximos permisibles, los establecidos por la autoridad para el manejo sustentable de la Cuenca del lago de Izabal y Río Dulce.