Identificação de regiões genômicas implicadas no catabolismo de biomassa lignocelulósica pelo fungo Trichoderma harzianum IOC-3844 = Identification of genomic regions related to catabolism of lignocellulosic biomass by the fungus Trichoderma harzianum IOC-3844

Identification of genomic regions related to catabolism of lignocellulosic biomass by the fungus Trichoderma harzianum IOC-3844

dc.creatorCrucello, Aline, 1986-
dc.date2014
dc.date2017-04-02T11:21:02Z
dc.date2017-07-19T13:08:16Z
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dc.date.accessioned2018-03-29T04:45:15Z
dc.date.available2018-03-29T04:45:15Z
dc.identifierCRUCELLO, Aline. Identificação de regiões genômicas implicadas no catabolismo de biomassa lignocelulósica pelo fungo Trichoderma harzianum IOC-3844 = Identification of genomic regions related to catabolism of lignocellulosic biomass by the fungus Trichoderma harzianum IOC-3844. 2014. 107 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.bibliotecadigital.unicamp.br/document/?code=000940715>. Acesso em: 2 abr. 2017.
dc.identifierhttp://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/316509
dc.identifier.urihttp://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/1350316
dc.descriptionOrientadores: Anete Pereira de Souza, Sindélia Freitas Azzoni
dc.descriptionTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
dc.descriptionResumo: O Brasil é hoje referência mundial na produção de etanol produzido a partir da cana-de-açúcar, cujo consumo tem aumentado significativamente nos últimos anos. Entretanto, a produção atual de etanol a partir do suco da cana-de-açúcar é insuficiente para atender a demanda do mercado nacional e internacional. Nesse contexto, a produção de etanol celulósico (de segunda geração) emergiu como uma alternativa promissora ao bioetanol de primeira geração. O fungo filamentoso Trichoderma harzianum IOC-3844 é uma linhagem brasileira que se destaca pela alta capacidade de produção de enzimas do complexo das celulases e hemicelulases, característica de grande interesse em biocatálise para conversão de biomassa em monômeros de açúcar fermentáveis. Apesar de seu comprovado potencial, há poucos dados de literatura disponíveis a respeito de sua capacidade celulolítica. Desta forma, este projeto teve como objetivo principal contribuir para o conhecimento básico sobre regiões do genoma de T. harzianum IOC-3844 envolvidas na via de hidrólise de compostos celulósicos, através da construção de uma biblioteca genômica de BAC (bacterial artificial chromosome). A biblioteca de BACs conta com 5760 clones, com insertos de DNA de tamanho médio de 90 kb, o que dá uma cobertura de aproximadamente 12 vezes o genoma de T. harzianum. Através da seleção de clones contendo genes de interesse, foram identificadas regiões com altas concentrações de genes relacionados à hidrólise de biomassa. Além disso, a combinação de dados genômicos, obtidos através da biblioteca de BACs, juntamente com dados de transcriptoma possibilitou a identificação de novos potenciais genes regulatórios. Os resultados trazem grande contribuição para a pesquisa associada a T. harzianum e à genômica de fungos relacionada à produção de etanol de segunda geração
dc.descriptionAbstract: Brazil is a world reference in sugarcane ethanol production, whose consumption has increased significantly in recent years. However, the current production of ethanol from sugarcane juice is insufficient to meet the demand of national and international market. In this context, the production of cellulosic ethanol (second generation) has emerged as a promising alternative to first-generation bioethanol. The filamentous fungus Trichoderma harzianum IOC-3844 is a Brazilian strain known for its high ability to produce enzymes of cellulosic and hemicellulosic complex, characteristic of great interest in biocatalysis for conversion of biomass into fermentable sugar monomers. Despite its potential, there are few published data available regarding its cellulolytic ability. Thus, this project aimed to contribute to the basic knowledge about regions of the genome of T. harzianum IOC-3844 involved in the hydrolysis of cellulosic compounds pathway, through the construction of a genomic BAC (bacterial artificial chromosome) library. The BAC library comprises 5,760 clones with an average DNA insert size of 90 kb, which represents about 12-fold coverage of the T. harzianum genome. Through the selection of clones containing genes of interest, regions containing high concentrations of genes related to biomass hydrolysis were identified. Furthermore, the combination of genomic data obtained from BAC library together with transcriptome data allowed the identification of novel potential regulatory genes. The results bring great contribution to studies related to T. harzianum and to fungal genomics regarding second generation bioethanol production
dc.descriptionDoutorado
dc.descriptionGenetica de Microorganismos
dc.descriptionDoutora em Genética e Biologia Molecular
dc.format107 p. : il.
dc.formatapplication/pdf
dc.languageInglês
dc.publisher[s.n.]
dc.subjectBioetanol
dc.subjectCelulase
dc.subjectTrichoderma
dc.subjectGenomas
dc.subjectRNA-seq
dc.subjectBioethanol
dc.subjectCellulase
dc.subjectTrichoderma
dc.subjectGenomes
dc.subjectRNA-seq
dc.titleIdentificação de regiões genômicas implicadas no catabolismo de biomassa lignocelulósica pelo fungo Trichoderma harzianum IOC-3844 = Identification of genomic regions related to catabolism of lignocellulosic biomass by the fungus Trichoderma harzianum IOC-3844
dc.titleIdentification of genomic regions related to catabolism of lignocellulosic biomass by the fungus Trichoderma harzianum IOC-3844
dc.typeTesis


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