Differential gene expression of citrus genotypes in response to Citrus leprosis C (CiLV_C) infection

dc.creatorKubo, Karen Sumire, 1980-
dc.date2011
dc.date2017-04-01T02:04:26Z
dc.date2017-07-19T13:06:17Z
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dc.date2017-07-19T13:06:17Z
dc.date.accessioned2018-03-29T04:43:55Z
dc.date.available2018-03-29T04:43:55Z
dc.identifierKUBO, Karen Sumire. Expressão gênica diferencial de genótipos de citros em resposta à infecção do vírus da leprose (CiLV-C). 2011. 167 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.bibliotecadigital.unicamp.br/document/?code=000839328&opt=1>. Acesso em: 31 mar. 2017.
dc.identifierhttp://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314473
dc.identifier.urihttp://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/1350001
dc.descriptionOrientadores: Marcos Antonio Machado, Juliana de Freitas Astúa
dc.descriptionTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
dc.descriptionResumo: O Citrus leprosis virus C (CiLV-C) é o agente causal da leprose dos citros, uma doença incomum transmitida pelo ácaro Brevipalpus phoenicis. Uma vez que o CiLV-C permanece confinado em lesões localizadas nas folhas, ramos e frutos sem causar infecção sistêmica, o vetor precisa se alimentar nestas lesões para adquirir o vírus. O objetivo deste trabalho foi analisar os perfis de expressão diferencial entre um genótipo resistente (tangor 'Murcott') e um suscetível (laranja 'Pera') em resposta à leprose dos citros e identificar os possíveis mecanismos de resistência envolvidos na resistência à doença. Por esse motivo, antes da instalação dos experimentos biológicos, nós aperfeiçoamos a detecção do CiLV-C em seu vetor, para certificação da aquisição viral. O experimento biológico incluiu quatro grupos: genótipo resistente ou suscetível infestados com ácaros virulíferos ou avirulíferos para CiLV-C. Com o intuito de se identificar genes diferencialmente expressos, nós utilizamos lâminas de microarranjo com sondas baseadas na base de dados do Citrus EST (CitEST). As análises estatísticas foram realizadas por two-way ANOVA considerando os fatores genótipo e a infecção pelo CiLV-C, de maneira a se encontrar respostas envolvidas na resistência ao CiLV-C. Os resultados foram interpretados por Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Os resultados sugerem que existem receptor-like proteins (RLP) e receptor-like kinase (RLK) que podem reconhecer o vírus ou o ácaro, ativando uma resposta de defesa baseada na assinatura de 'Ca POT.2+' e ativação da via do ácido salicílico. Estudos adicionais ainda são necessários para verificar se a resposta de defesa pode estar relacionada à resistência sistêmica adquirida (SAR)
dc.descriptionAbstract: Citrus leprosis virus C (CiLV-C) is the causal agent of citrus leprosis, an unusual disease transmitted by the mite Brevipalpus phoenicis. Since CiLV-C remains confined in localized lesions in leaves, stems and fruits without causing systemic infection, the vector needs to feed in these lesions to acquire the virus. The aim of this work was to analyze the differential gene expression profiles between resistant ('Murcott' tangor) and susceptible ('Pera' sweet orange) citrus genotypes in response to CiLV-C, and to identify possible mechanisms involved in disease resistance. For this reason, before the biological experiments were set, we improved the detection of CiLV-C in the mite vector to ensure virus acquisition. The biological experiment consisted in four groups: susceptible or resistant genotype infested with CiLV-C viruliferous or nonviruliferous mites. In order to identify differentially expressed genes, we used microarray chips designed using the Citrus EST database (CitEST). The statistical analysis was performed by two-way ANOVA considering the genotype and the infection by CiLV-C, aiming to find defense responses against CiLV-C. The results were interpreted by Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) and led to the hypothesis that receptor-like proteins (RLP) and receptor-like kinase (RLK) may recognize the virus or the mite triggering a defense response based on 'Ca POT.2+' signature and activation of Salicylic acid pathway (SA). Further studies are necessary to evaluate if the defense response could be related to the development of systemic acquired resistance (SAR)
dc.descriptionDoutorado
dc.descriptionBioquimica
dc.descriptionDoutor em Biologia Funcional e Molecular
dc.format167 p. : il.
dc.formatapplication/pdf
dc.languagePortuguês
dc.publisher[s.n.]
dc.subjectLeprose dos citros
dc.subjectVirus - Identificação
dc.subjectReação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa
dc.subjectCítricos
dc.subjectDefesas de plantas
dc.subjectCitrus leprosis
dc.subjectVirus - Identification
dc.subjectReverse transcriptase polymerase chain reaction
dc.subjectCitrus
dc.subjectPlant defenses
dc.titleExpressão gênica diferencial de genótipos de citros em resposta à infecção do vírus da leprose (CiLV-C)
dc.titleDifferential gene expression of citrus genotypes in response to Citrus leprosis C (CiLV_C) infection
dc.typeTesis


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