Infection by Sugarcane yellow leaf virus (ScYLV) causes severe leaf symptoms in sugarcane (Saccharum spp.) hybrids, which indicate alterations in its photosynthetic apparatus. To gain an overview of the physiological status of infected plants, we evaluated chlorophyll a fluorescence and gas exchange assays, correlating the results with leaf metabolic surveys, i.e., photosynthetic pigments and carbohydrate contents. When compared to healthy plants, infected plants showed a reduction in potential quantum efficiency for photochemistry of photosystem (PSII) and alterations in the filling up of the plastoquinone (PQ) pool. They also showed reduction in the CO2 net exchange rates, probably as a consequence of impaired quantum yield. In addition, reductions were found in the contents of photosynthetic leaf pigments and in the ratio chlorophyll a/chlorophyll b (chla/chlb). Carbohydrate content in the leaves was increased as a secondary effect of the ScYLV infection. This article discusses the relation of virus replication and host defense responses with general alterations in the photosynthetic apparatus and in the metabolism of infected plants.O vírus do amarelecimento foliar da cana-de-açúcar (Sugarcane yellow leaf virus, ScYLV) causa sintomas foliares severos e típicos de infecção por luteovirus, em cana-de-açúcar (Saccharum spp.). Uma vez que alterações no sistema fotossintético da planta seriam esperadas, avaliaram-se a análise da emissão da fluorescência da clorofila a e as trocas gasosas durante a fotossíntese, relacionando esses dados com análises metabólicas, ou seja, conteúdos de pigmentos fotossintéticos e carboidratos presentes nas folhas. As plantas infetadas apresentaram redução na eficiência quântica fotoquímica potencial do fotossistema II (PSII) e alterações no preenchimento do pool de plastoquinona (PQ). Essas plantas apresentaram, também, redução nas taxas de troca líquida de CO2, provavelmente em conseqüência da redução na eficiência quântica. Paralelamente, reduções nos conteúdos de pigmentos fotossintéticos foliares e na razão clorofila a/clorofila b (chla/chlb) foram verificadas. Adicionalmente, o conteúdo de açúcares nas folhas foi aumentado, provavelmente como um efeito secundário da infecção viral. A relação entre a replicação viral e as respostas de defesa da hospedeira com as alterações encontradas no aparelho fotossintético e no metabolismo das plantas infetadas é discutida.1016