Evaluation of methods of Neotropical Savanna plant samples preservation for yielding high quality DNA for molecular studies

dc.creatorFeres, Fabíola
dc.creatorSouza, Anete P. de
dc.creatorAmaral, Maria do Carmo E. do
dc.creatorBittrich, Volker
dc.date2005-06-01
dc.date2014-07-18T13:19:02Z
dc.date2015-11-26T11:38:44Z
dc.date2014-07-18T13:19:02Z
dc.date2015-11-26T11:38:44Z
dc.date.accessioned2018-03-28T20:42:07Z
dc.date.available2018-03-28T20:42:07Z
dc.identifierBrazilian Journal of Botany. Sociedade Botânica de São Paulo, v. 28, n. 2, p. 277-283, 2005.
dc.identifier0100-8404
dc.identifierS0100-84042005000200008
dc.identifier10.1590/S0100-84042005000200008
dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-84042005000200008
dc.identifierhttp://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042005000200008
dc.identifierhttp://www.repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/30903
dc.identifierhttp://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/30903
dc.identifier.urihttp://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/1234029
dc.descriptionMethods for the preservation of leaf sample from plants occurring in neotropical savannas were compared, with the aim to get high quality DNA for molecular studies. Different methods for DNA isolation of the same samples were also compared. The DNA quality was evaluated by two empirical methods: digestion of the DNA with three restriction enzymes and by amplification of the mitochondrial cox3 gene by PCR. The results show that, for the savanna plants investigated, the most commonly employed method for plant sample preservation (quick dehydratation using silica gel) is not the most efficient. Our results demonstrate the importance of testing different methods of plant tissue preservation for molecular studies to guarantee high quality DNA. For plants from neotropical savannas, the silica gel method might be often less efficient than other equally simple methods of sample preservation.
dc.descriptionForam comparadas metodologias para preservação de amostras de folhas de plantas de savanas neotropicais, visando a posterior obtenção de DNA de alta qualidade para estudos moleculares. Foram também testadas diferentes metodologias para extração de DNA das amostras investigadas. A qualidade do DNA extraído foi avaliada através de dois métodos: por digestão, utilizando-se três enzimas de restrição e através da amplificação do gene mitocondrial cox3 (subunidade III da citocromo oxidase) por PCR. Os resultados revelaram que, para as plantas de savanas investigadas, a metodologia de preservação de amostras mais comumente empregada pelos botânicos (desidratação rápida usando sílica-gel) não é a mais eficiente. Os resultados obtidos demonstram a importância de testar diferentes métodos de preservação de amostras vegetais para estudos moleculares, para garantir a obtenção de DNA de alta qualidade. Para as plantas de savanas neotropicais, o método de preservação em sílica gel pode ser menos eficiente do que outros métodos igualmente simples de preservação de amostras.
dc.description277
dc.description283
dc.descriptionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
dc.languagept
dc.publisherSociedade Botânica de São Paulo
dc.relationBrazilian Journal of Botany
dc.rightsaberto
dc.sourceSciELO
dc.subjectanálises moleculares
dc.subjectextração de DNA
dc.subjectplantas de savanas tropicais
dc.subjectpreservação de amostras
dc.subjectsistemática molecular
dc.subjectDNA isolation
dc.subjectmolecular analysis
dc.subjectmolecular systematics
dc.subjectsample preservation
dc.subjecttropical savanna plants
dc.titleAvaliação de métodos de preservação de amostras de plantas de savanas neotropicais para a obtenção de DNA de alta qualidade para estudos moleculares
dc.titleEvaluation of methods of Neotropical Savanna plant samples preservation for yielding high quality DNA for molecular studies
dc.typeArtículos de revistas


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