En la presente investigación se plantea: Seleccionar las mejores familias de maíz negro y de maíz chulpi e incrementar y conservar semillas de cada una de las familias seleccionadas, para lo cual se establecieron dos ensayos uno de 162 Familias de Medios Hermanos Maternos de Maíz Negro y otro de 120 Familias de Medios Hermanos Maternos de maíz Chulpi. Evaluando parámetros cualitativos y cuantitativos. Utilizando el Asistente de Selección, que forma parte del programa Alpha Latice. La selección de las mejores familias se realizó en base a las variables de mayor interés agronómico, como son: días a la floración femenina, altura de planta, altura de mazorca, acame de tallo, porcentaje de pudrición de mazorca y rendimiento. Obteniendo 20 familias seleccionas para cada uno de estos dos tipos de maíces, en el caso de maíz negro se obtuvo un incremento de semilla de 77 mazorcas y de 84 mazorcas para maíz chulpi, las mismas que constituirán nuevas familias de medios hermanos en un segundo ciclo de selección. Concluyendo que existe la suficiente cantidad de semilla para continuar con el proceso de mejoramiento genético de maíz negro y maíz chulpi y que la variabilidad genética de cada raza es heterogénea, ratificándose, además, la alta variabilidad genética de las especies alógamas. Recomendando investigar nuevas alternativas de uso tanto de maíz negro como de maíz chulpi con la finalidad de diversificar su utilización e incentivar a los agricultores a conservar estos dos tipos de maíz