En el frijol común uno de los principales problemas relacionados con su producción es el daño ocasionado por enfermedades, entre las más relevantes está la mancha angular. Esta enfermedad está delimitada a regiones tropicales y subtropicales, causa reducciones en rendimientos de 40% hasta 80% de la producción. El objetivo fue identificar y utilizar marcadores moleculares RAPD y SCAR como herramientas para la selección en el mejoramiento por resistencia genética del frijol común a la mancha angular en Zamorano. El material que se usó fue de una población segregante F4 identificada como ALS 9951, derivada de la cruza de Tío Canela-75 (susceptible) ´ G06727 (resistente). El procedimiento a seguir incluyó la siembra, inoculación y evaluación en camas de infección de las poblaciones F5 y F6 y los padres. La reacción fenotípica a la incidencia de la enfermedad se utilizó como referencia en la búsqueda de marcadores moleculares ligados a la misma. Para ello, se utilizaron 44 cebadores RAPD. Se evaluó la reacción fenotípica a la inoculación en el laboratorio la presencia de bandas polimórficas ligadas a esta reacción fue la variable evaluada usando la prueba de Chi-cuadrado (c2) de Pearson para bondad de ajuste de las proporciones fenotípicas y genotípicas esperadas y observadas. Se usó el marcador molecular SCAR NO2 que indica la presencia del gen Phg–2 que fue adaptado para las condiciones del laboratorio de Biología Molecular de Zamorano y se encontró que no hay ajuste con un P 0.01 demostrándose así que los valores observados se atribuyen al azar; por esta razón es importante la identificación de marcadores moleculares RAPD como primer paso para encontrar marcadores moleculares potenciales. Se lograron identificar cinco marcadores RAPDs WO61200, G31400 , G31100, W091100, PO9 300 y B101200 ligados a la resistencia a la mancha angular, empleando mezclas compuestas de ADN de plantas resistentes y susceptibles, los cuales se comprobaron en la siguiente generación en la población F6; estos marcadores fueron utilizados en plantas individuales (F6). El marcador G31400 muestra el ajuste más alto, considerándolo así como el marcador molecular más confiable en este estudio.1. Indice de cuadros 2. Indice de figuras 3. Introducción 4. Revisíon de literatura 5. Materiales y métodos 6. Resultados y discusión 7. Conclusiones 8. Recomendaciones 9. Referencias bibliográficas 10. Anexos