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Clórosis : Tesis presentada ante la Facultad de Medicina de Buenos Aires, el 28 de junio de 1855 por Cleto Aguirre, natural de Salta (República Argentina)Ex-practicante mayor del Hospital General de Hombres, y doctor en Medicina de dicha Facultad
(Imprenta "de Mayo", Calle de Belgrano Num. 86Buenos Aires, 1855)
Contribución al diagnóstico de las enfermedades del fondo del ojo : Observaciones tomadas en el Servicio Clínico de Oftalmología del doctor Aguirre en nuestra Escuela de Medicina
(Imprenta M. Biedma, calle de Belgrano número 135Buenos Aires, 1878)
Relaciones de la menstruación con el sistema nervioso : Tesis para el doctorado
(Imprenta de El Tribuno, Victoria 21Buenos Aires, 1881)
La versión en dos casos de presentación de tronco observados en la clínica de partos : Tesis para el doctorado
(Imprenta M. Biedma, calle de Belgrano números 133 y 135Buenos Aires, 1876)
Cromopsia : Tesis inaugural
(Imprenta M. Biedma, Belgrano 133 a 139Buenos Aires, 1887)
Degeneración de la especie en los matrimonios consanguíneos : Tesis presentada para optar al grado de doctor en medicina
(Imprenta Moreno, calle 25 de Mayo 112, número nuevoBuenos Aires, 1888)
Ruptura prematura y espontánea de las membranas del huevo : Tesis para el doctorado
(Imprenta de Juan A. Alsina, México 635Buenos Aires, 1884)
Contribución al estudio práctico de las irido-coroiditis : Tesis para el doctorado
(Imprenta M. Biedma, calle de Belgrano número 135Buenos Aires, 1879)