Tesis
Diversidad y filogenia de Burkholderia sp. aisladas en diferentes regiones del estado de Puebla
Fecha
2016-11Autor
CERVANTES ALVAREZ, ISRAEL; 534035
Cervantes Álvarez, Israel
Resumen
"Burkholderia es un género extremadamente diverso y versátil, Gram-negativo y de forma bacilar. Se han descrito actualmente un gran número de especies que se incorporan a éste género llegando a ser 101 especies ya reportadas. Se reconoce la diversidad en torno a la patogenicidad de algunas especies en humanos, animales y plantas, pero destaca también el uso potencial de algunas especies por sus bondades en la promoción del crecimiento de plantas, la fitorremediación, la degradación de agentes xenobióticos, y el biocontrol de agentes patógenos de plantas. Este trabajo trata de la búsqueda de especies pertenecientes al género Burkholderia basándose en la diversidad climática en el Estado de Puebla en donde se tomaron en cuenta los climas cálido subhúmedo, templado subhúmedo, seco-semiseco, templado húmedo y cálido húmedo. Es importante la observación de la escaces de estudios en torno a este género en México, los estudios se han limitado a estados como Chiapas, Veracruz, Morelos, Tamaulipas, en el Estado de Puebla no hay reportes acerca de Burkholderia spp. Este estudio es parte de dos trabajos anteriormente realizados que conforman una colección de muestras de un total de 96 cepas con alta probabilidad de ser Burkholderia spp. Se hace además una búsqueda previa que nos ayuda a rastrear especies con probable potencial de fijar nitrógeno, especies que pertenezcan a el denominado grupo “Burkholderias del complejo cepacia” y un tercer grupo enfocado a tres especies patógenas de plantas: B. gladioli, B. plantarii y B. glumae. Esta búsqueda fue realizada con un grupo o “set” de oligonucleótidos que van dirigidos hacia diferentes genes de mantenimiento y ya han sido reportados previamente en la literatura. Es importante conocer el papel que puede tener este género en el ámbito agrícola, el área de la salud y el área ecología-ambiental. Se muestran resultados de la secuenciación y el análisis filogenético del gen ribosomal 16S de las cepas obtenidas de diversas fuentes de interés agrícola, algunas plantas silvestres además de un par de cuerpos de agua, esto esperando entender un poco mas las interacciónes que puedan tener estas bacterias con diferentes hospederos, conformando finalmente un total de 47 cepas confirmadas como Burkholderia spp. de 96 aislamientos iniciales con potencial de pertenecer a este género. Se evaluó la diversidad genética con base en la prueba de diversidad nucleotídicay el gen codificante para la subunidad 16S ribosomal para las 47 cepas confirmadas como Burkholderia spp. mostrando los valores de diversidad entre los tres grupos, además de los valores comparados entre los distintos grupos y finalmente los valores de diversidad nucleotídica por grupo único."