El lago Atitlán ha sufrido cambios en la composición y estructura de su fitoplancton en los últimos años debido a la eutrofización cultural. Para poder entender los fenómenos (físicos y/o químicos) que influyen en la dinámica del fitoplancton en el lago, se estudiaron las variaciones espaciales y temporales de la comunidad de fitoplancton en función de los factores abióticos en el Lago Atitlán durante el año 2013. Se colectaron muestras de enero a diciembre del 2013 en los sitios Panajachel, Santiago y Centro, en 4 profundidades diferentes (0, 5, 10 y 20m) y se realizaron análisis químicos, biológicos y físicos. Para los 3 sitios se reportan en total 19 especies pertenecientes a cuatro taxones principalmente, Dinophyta, Bacillariophyta, Chlorophyta y Cyanophyta. Se observó una dominancia de las Bacillariophytas (diatomeas) de enero a marzo; en abril y mayo las Chlorophytas (algas verdes) fueron dominantes y de junio a diciembre las Cyanophytas (cianobacterias).