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Genetic variability of Senepol cattle in Colombia using molecular markers
Variabilidad genética de bovinos Senepol en Colombia por marcadores moleculares
Registro en:
Sepulveda Restrepo JC, Ángel Marín PA, Toro A, Corrales Álvarez JD, Moreno Ochoa MA, Cerón Muñoz MF. Genetic variability of Senepol cattle in Colombia using molecular markers. Rev. colomb. cienc. pecu. 2012 Jun; 25(2): 183-190
0120-0690
2256-2958
Autor
Sepulveda Restrepo, Jeannie Cerlyn
Ángel Marín, Paula Andrea
Toro Toro, Alejandra
Corrales Álvarez, Juan David
Moreno Ochoa, Manuel Antonio
Cerón Muñoz, Mario Fernando
Institución
Resumen
ABSTRACT: The Senepol beef cattle breed was introduced into Colombia through the use of artificial insemination
and embryo transfer from a small nucleus of animals. Objective: to estimate the genetic variability of
Senepol cattle in Colombia by heterologous microsatellites and to estimate gene and genotypic frequencies
of single nucleotide polymorphic markers through calpastatin (CAST1), calpain (CALP316), and leptin
(PB) genes. Methods: 412 blood samples from 28 herds were genotyped for population genetic structure
with the STR: INRA32, BM2113, ETH10, BM1824, INRA037, ETH225, INRA064, SPS115, TGLA126,
and TGLA122 microsatellite markers. Three SNPs of calpastatin, calpain, and leptin genes were used.
Results: all microsatellites and SNP markers were polymorphic. The number of alleles ranged from 4
(BM1824) to 11 (INRA37), and the observed heterozygosity varied between 0.21 (INRA64) and 0.89
(BM2113). Combined probability of exclusion for the microsatellites was higher than 99.99%, indicating
the usefulness of this set of markers for parentage testing in Senepol. Conclusions: despite being a small
and closed population, this nucleus presents high genetic variability and low inbreeding. RESUMEN: El ganado Senepol fue introducido en Colombia mediante el uso de la inseminación artificial y
transferencia de embriones de un pequeño núcleo de los animales. Objetivo: estimar la variabilidad genética
del ganado Senepol de Colombia por medio de marcadores microsatélites y estimar las frecuencias alélicas
y genotípicas de SNPs en los genes que codifican para la calpastatina (CAST1), calpaína (CALP316) y leptina (PB). Métodos: 412 muestras de sangre de animales pertenecientes a 28 fincas fueron analizados
para los STRs: INRA32, BM2113, ETH10, BM1824, INRA037, ETH225, INRA064, SPS115, TGLA126
y TGLA122 y los tres SNPs. Resultados: los microsatélites y los SNPs fueron polimórficos. El número
de alelos de los microsatélites variaron entre 4 (BM1824) y 11 (INRA37), la heterocigosidad observada
varió entre 0.21 (INRA64) y 0.89 (BM2113). La probabilidad de exclusión para el total de microsatélites
fue mayor que 99.99%, indicando que el conjunto de microsatélites pueden ser usados para pruebas de
filiación. Conclusiones: a pesar de ser una población pequeña y cerrada, este núcleo presenta una alta
variabilidad genética y baja consanguinidad. COL0006779