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Identification of carbohydrate degrading bacteria in sub-tropical regions
Identification of carbohydrate degrading bacteria in sub-tropical regions
Autor
Rosado, William
Govind, Nadathur S.
Institución
Resumen
Several bacteria from the islands of Puerto Rico, Vieques and Trinidad were isolated for their carbohydrate degrading activities. These terrestrial and marine bacterium were collected from pineapple agricultural lands, tropical rain forests, coastlands and mangrove swamps. Organisms were screened for activity using chromogenic substrates (AZCL® Megazyme International Ltd., Ireland). The media composition for the effective culturing of some of the marine organisms has also been standardized. Gram-negative organisms were identified by sequence analysis of the PCR- amplified partial small subunit rRNA gene. Results indicate that the majority of the marine organisms tested belong to the genera Vibrio and Pseudoalteromonas and in the terrestrial environments Chryseobacterium predominated. These experiments reveal that sub-tropical environments are potentially good sources of microorganisms with novel carbohydrase activities. Se aislaron varias bacterias de las islas de Puerto Rico, Vieques y Trinidad por su actividad de degradar carbohidratos. Estas bacterias terrestres y marinas fueron colectadas de suelos para cultivo de piña, bosque lluvioso tropical, costas y pantanos de manglar. Utilizando sustratos de carbohidratos con enlaces cromogénicos (AZCL® Megazyme International Ltd., Ireland) se seleccionaron aquellos organismos que poseían actividad. La composición del medio para el cultivo efectivo de los organismos marinos fue estandarizada. Organismos Gram negativo fueron identificados por análisis de secuencia de la amplificación parcial por PCR del gen 16S de la subunidad pequeña del ARNr. Los resultados indican que la mayoría de los organismos marinos estudiados pertenecen al género Vibrio y Pseudoalteromonas y que en los ambientes terrestres predominó Chryseobacterium. Estos experimentos revelaron que los ambientes subtropicales son potencialmente buenas fuentes de microorganismos con novedosas actividades de carbohidrasas.