Tesis Doctorado
Evaluación de patrones de expresión génica en respuesta a distintas concentraciones DHA en tejido hepático y mandibular de Seriola lalandi in vitro
Evaluation of gene expression patterns in response to different DHA concentrations in hepatic and mandibular Seriola lalandi tissue in vitro;
Evaluación de patrones de expresión génica en respuesta a distintas concentraciónes dha en tejido hepático y mandibular de serióla lalandi in vitro;
evaluatión of gene expressión patterns in response to different dha concentratións in hepatic and mandibular serióla lalandi tissue in vitro
Fecha
2018Autor
Martínez Moncada, Víctor
Gormaz Araya, Juan Guillermo
UNIVERSIDAD DE CHILE
Institución
Resumen
Seriola lalandi es un pez teleósteo marino con un alto potencial para su uso en la acuicultura. Sin embargo, una de las principales limitaciones para su cultivo es la aparición impredecible de deformidades mandibulares en etapas tempranas, constituyendo uno de los mayores desafíos para su producción.
Evidencia preliminar cualitativa sugería que factores nutricionales, incluyendo niveles de ácidos grasos esenciales en la dieta se han relacionado con la aparición de malformaciones óseas. En el presente estudio se analizaron los factores transcripcionales relacionados con una malformación mandibular. Se recolectaron dos grupos de juveniles a los 40 días post eclosión procedente de diferentes desoves del mismo lote de reproductores. Los juveniles normales y deformes fueron muestreados a priori basados en la anomalía de la mandíbula inferior alargada. Se utilizaron pool de aislados de ARN de mandíbula inferior e hígado por cada fenotipo mandibular para el secuenciamiento masivo de ARN. Las lecturas filtradas se mapearon a un transcriptoma de referencia. Se identificaron 1445 transcritos expresados diferencialmente en la mandíbula (FDR<0.05). De estos, 1387 transcritos se sobreexpresaron y 58 transcritos se subexpresaron en el grupo deforme. En el caso del hígado no se observó expresión diferencial. Los resultados sugieren que las vías implicadas en los procesos de la matriz extracelular, procesos de osteoblastogénesis y transportadores lipìdicos son de gran importancia para el crecimiento mandibular normal. Aún queda por establecer si las Apolipoproteínas directamente o indirectamente regulan la masa ósea en peces pero nuestro estudio coloca en antecedente su participación en el tejido óseo como la mandíbula.
Debido al rol que se atribuye a los ácidos grasos como el DHA en malformaciones óseas en peces, en este estudio se midió el contenido de DHA en ambos fenotipos. Nuestros resultados mostraron que en el tejido mandibular deforme el contenido de DHA fue significativamente menor comparado con mandíbula normal. Adicionalmente, evaluamos la acción in situ del DHA en el tejido mandibular en el cultivo in vitro, comparando los transcritos expresados diferencialmente entre el RNA-Seq del suplemento de cultivo in vitro con DHA y cultivo in vivo. Se observó una concordancia entre los transcritos expresados diferencialmente in vitro e in vivo, incluidos los transcriptos asociados con el transporte de lípidos, fibronectina y peroxisomas. Una deficiencia del contenido de DHA en el tejido con deformidad mandibular y el efecto del DHA en el componente de la matriz extracelular indican la importancia de este acido graso a nivel local y su papel en la formación de este tejido, que ha sido poco estudiado en peces.