Trabajo de grado - Maestría
Phylogeographic origin determination of Helicobacter pylori strains from a Colombian cohort by multilocus sequence typing (MSLT)
Fecha
2018Registro en:
instname:Universidad de los Andes
reponame:Repositorio Institucional Séneca
Autor
Ulloa Guerrero, Cindy Pamela
Institución
Resumen
Helicobacter pylori is a gram-negative bacterium associated to diverse pathologies ranging from gastritis to gastric cancer. Due to its clinical and evolutionary importance, there has been extensive research focused on its transmission mechanisms, population genetics and phylogenetic relationships among different H. pylori isolates world-wide. Until now, population genetic studies have focused on the amplification of 7 different housekeeping genes using Multilocus Sequence Typing (MLST). With this technique, a correlation between the ancestry of H. pylori and the risk of developing a severe pathology like gastric cancer has been reported. In Colombia, this type of research has been done mainly in patients from the cities in the Andean and Pacific Regions (Túquerres and Tumaco, respectively). However, to our knowledge, in Bogotá, the capital of Colombia, there have been only two MLST studies. For this reason, in the present study we determined the ancestry of 52 H. pylori strains obtained from a cohort of symptomatic patients infected with this bacterium from Hospital Fundación Santa Fe de Bogotá. Additionally, to adress whether a correlation exists between the ancestry of H. pylori, the presence of the cytotoxin- associated gene A (cagA) and pathology of each patient, the cagA was amplified for all strains. This analysis showed that all strains evaluated belonged to the hpEurope group and there was no correlation with the cagA gene presence and the severity of the pathology for our sampled population. We complemented these results with the analysis of several Latin American Strains published recently, finding a clustering of the isolated strains with other Colombian strains creating a distinct group from those isolated in Nicaragua and Mexico. Helicobacter pylori es una bacteria gram-negativa asociada a diversas patologías que van desde gastritis hasta cáncer gástrico. Debido a su importancia clínica y evolutiva, ha habido una extensa investigación centrada en sus mecanismos de transmisión, genética de poblaciones y relaciones filogenéticas entre diferentes aislamientos de H. pylori en todo el mundo. Hasta ahora, los estudios genéticos poblacionales se han enfocado en la amplificación de 7 genes de mantenimiento diferentes usando el Tipificación por Secuención Multilocus (MLST). Con esta técnica, se ha informado una correlación entre la ascendencia de H. pylori y el riesgo de desarrollar una patología grave, como lo es el cáncer gástrico. En Colombia, este tipo de investigación se ha realizado principalmente en pacientes de las ciudades de las regiones andina y del Pacífico (Túquerres y Tumaco, respectivamente). Sin embargo, hasta el momento, en Bogotá, la capital de Colombia, solo ha habido dos estudios de MLST. Por este motivo, en el presente estudio determinamos la ascendencia de 52 cepas de H. pylori obtenidas de una cohorte de pacientes sintomáticos infectados con esta bacteria del Hospital Universitario Fundación Santa Fe de Bogotá. Además, para determinar si existe una correlación entre la ascendencia de H. pylori, la presencia del gen asociado a citotoxina A (cagA) y la patología de cada paciente, el cagA se amplificó para todas las cepas. Este análisis mostró que todas las cepas evaluadas pertenecían al grupo hpEurope y no hubo correlación con la presencia del gen cagA y la gravedad de la patología para nuestra población muestreada. Complementamos estos resultados con el análisis de varias cepas latinoamericanas publicadas recientemente, y encontramos un agrupamiento de las cepas aisladas con otras cepas colombianas que crean un grupo distinto de las aisladas en Nicaragua y México.