Trabajo de grado - Maestría
Caracterización morfológica, morfométrica y molecular de Pratylenchus y Radopholus en Musa spp., en el eje cafetero y el Valle del Cauca, Colombia
Fecha
2022-05-19Registro en:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
Autor
Arboleda Riascos, Carlos Emiro
Institución
Resumen
Los nematodos fitoparásitos causan pérdidas entre 30 y 80% de la producción de
plátano (Musa AAB Simmonds - Dominico Hartón) y banano (Musa acuminata) en
campos altamente infestados. En las zonas de mayor producción de Musa en
Colombia, su manejo fitosanitario ha sido limitado por el desconocimiento de las
especies de nematodos presentes. Con el propósito de conocer las especies de
Pratylenchus y Radopholus asociadas a cultivos de plátano y banano en los
departamentos de Caldas, Quindío, y Valle del Cauca se colectaron muestras
compuestas de raíces y suelo rizosférico de diferentes sistemas de producción. En
el laboratorio de sanidad vegetal de la Universidad Nacional de Colombia, sede
Palmira, los nematodos fueron extraídos por el método de Cobb modificado e
identificados mediante análisis morfológico, morfométrico (mediciones de
caracteres diagnósticos) y molecular (amplificación por PCR y secuenciación del
segmento D2-D3 del ARN ribosomal y Citocromo oxidasa subunidad I [COI] del ADN
mitocondrial para Pratylenchus e Internal Transcribed Spacer-ITS del ARN
ribosomal para Radopholus). Los resultados mostraron, cinco poblaciones de P.
araucensis, así: dos del Valle del Cauca, dos de Quindío y una de Caldas, lo cual
indica que esta especie de nematodo, previamente reportada en Arauca (Colombia),
se encuentra ampliamente distribuida en el país. Mediante pruebas moleculares,
COI, las poblaciones se separaron por origen geográfico sugiriendo una amplia
variabilidad intraespecífica. Este estudio reporta las primeras secuencias de COI
para P. araucensis en el mundo. Por otro lado, tres poblaciones fueron identificadas
como R. similis, (dos de Caldas y una de Quindío) confirmándose la presencia de
esta especie de nematodo en las zonas estudiadas. A partir de esta información, a
futuro podrán plantearse eficientes programas de manejo integrado para las
especies identificadas. (Texto tomado de la fuente) Phytoparasitic nematodes cause losses between 30 and 80% of plantain (Musa AAB
Simmonds - Dominico Hartón) and banana (Musa acuminata) production in highly
infested fields. In the areas of greater production in Colombia, their phytosanitary
management has been limited by the wide ignorance of the nematode species
present. In order to know the Pratylenchus and Radopholus species associated with
plantain and banana crops in the departments of Valle del Cauca, Caldas and
Quindío, samples composed of roots and rhizospheric soil from different production
systems were collected. In the laboratory, the nematodes were extracted by the
modified Cobb method and identified by morphological, morphometric
(measurements of diagnostic characteristics) and molecular analysis (PCR
amplification and sequencing of the D2-D3 segment of ribosomal RNA and
Cytochrome oxidase I subunit [COI] of mitochondrial DNA for Pratylenchus and
Internal Transcribed Spacer-ITS of ribosomal RNA for Radopholus). According to
the results, five populations were identified as P. araucensis, two from Valle del
Cauca, two from Quindío and one from Caldas, which indicates that this nematode
species, previously reported in Arauca (Colombia), is widely distributed in the
country. Using molecular data, but especially COI, populations were separated by
geographic origin suggesting wide intraspecific variability. This study reports the first
COI sequences for P. araucencis in the world. On the other hand, three populations
(two from Caldas and one from Quindío) were identified as R. similis, confirming the
presence of this nematode species in the studied areas. Based on this information,
efficient integrated management programs for the identified species may be
proposed in the future.