En la presente investigación, se diseña un modelo de Credit Scoring empleando la técnica de regresión logística con la finalidad de calcular probabilísticamente la posibilidad del no pago de los clientes. Para ello se emplean datos de campo en el periodo 2011-2014 de Compartamos Banco, microfinanciera en estudio, ubicada en el municipio de Tenancingo, Estado de México. Así el modelo se convierte en una herramienta auxiliar para la toma de decisiones en instituciones microfinancieras en zonas rurales, por la bondad de ajuste y valor predictivo del modelo hace de este una propuesta viable para disminuir los índices de morosidad en dichas instituciones. Finalmente, el rigor teórico y metodológico en el análisis de dicha investigación nos permite proporcionar una serie de recomendaciones para mejorar el manejo del riesgo y la correcta toma de decisiones en las entidades microfinancieras.