A cheia de 2021 no rio Branco foi uma cheia com uma probabilidade de ocorrência anual de 16%. Ela foi causada por chuvas acima da média ao longo de vários meses, que fizeram com que o rio mantivesse níveis elevados ao longo de todo ano e uma umidade antecedente também alta. No início de junho, após chuvas não muito intensas porém contínuas, o rio alcançou níveis máximos anuais em quase todos os pontos de monitoramento. Esse período é relativamente cedo para ocorrência dos máximos anuais, que normalmente ocorrem em julho. Desde 2020, o SAH Branco iniciou a operação com horizontes de previsão de 15 dias, utilizando modelagem hidrológica chuva-vazão tendo como parâmetro de entrada um conjunto (Ensemble) de previsões. Isso fez com que, com maior antecedência, a equipe da CPRM tenha podido se comunicar com as autoridades locais acerca da possibilidade de inundação moderada que ocorreu. Essa atuação representa importante contribuição por parte da CPRM para um melhor gerenciamento das cheias no Estado. Tal fato só foi possível com a implantação de modelos de previsão chuva vazão, capazes de incorporar previsões de chuvas aos modelos hidrológicos operacionais na região.