Coccidiose é uma parasitologia especifica da especifica da espécie que acomete coelhos jovens que vivem em super lotação, com falta de cuidados higiênicos, na fase de desmame e com deficiência imunológica. Ela ocorre por um protozoário intracelular do gênero Eimeria, pode causar mortalidade significativa em coelhos domésticos. Existe mais de trinta espécies de coccídios descritos em lagomorfos, entretanto é comumente observada dez de maior patogenicidade. Há somente duas formas de coccidiose a hepática causada pela Eimeria stiedae e a intestinal causada pelas outras espécies de Eimeria. Eimeria flavescens e Eimeria intestinalis, são as eimerias intestinais mais patogênicas, contudo estes parasitas causam destruição das criptas intestinais resultando em diarréia e extunuação.