Objetivo: Analisar a incidência das intoxicações medicamentosas em crianças registradas no Centro de Informação e Assistência Toxicológica de Santa Catarina entre os anos de 2016 e 2020.Método: Estudo epidemiológico observacional, com delineamento de coorte histórica. Foi realizado a partir dos casos notificados de intoxicação por medicamentos em crianças de 0 a 12 anos. A amostra foi do tipo censo. Resultados: Foram notificadas 4.839 intoxicações medicamentosas em crianças no Estado de Santa Catarina no período, com taxa de incidência média anual de 6 casos/1.000 nascidos vivos. A idade apresentou mediana de 3 anos. A maioria (51,5%) dos casos de intoxicação ocorreu entre meninas, até os três anos de idade, de causa acidental, por exposição oral e no domicílio. Houve predomínio de sinais e sintomas que afetaram o sistema nervoso e apenas uma pequena parcela (6,2%) necessitou de hospitalização. A maioria dos casos (65,6%) foi considerada intoxicação leve com evolução favorável. Nenhum óbito foi registrado. Houve tendência de aumento dos casos ao longo do tempo, porém não significativo. Observa-se um predomínio de casos incidentes no Grande Oeste, seguido do Meio Oeste e Serra Catarinense. Conclusões: As intoxicações medicamentosas em crianças predominam na primeira infância, de forma acidental, sendo o ambiente doméstico o principal local. Esses achados destacam a importância de intensificar medidas preventivas e educativas entre familiares e cuidadores de crianças.