Bacterial resistance is one of the greatest world health threats, reducing the effective infections treatment and increasing mortality associated to common bacterial diseases. In this context, the strategies search for pathogens and antimicrobial resistance control is necessary. Two of the strategies developed to combat these microorganisms have been the combined antimicrobials therapy and antimicrobial peptides prospection. In the present work, we have investigated the in vitro peptides effectiveness prospected from the Cerrado soil and the in vitro effectiveness of antimicrobials diminazene aceturate, chloramphenicol and streptomycin alone and in combination against clinical isolates of E. coli, K. pneumoniae and S. aureus. For bioprospection, the material was collected from native Cerrado soil, the total proteins were extracted and the peptides were further identified by LC-MS / MS. Peptides were analyzed by sense the moment and CAMP algorithms, in order to predict antimicrobial peptides. Of all peptides with possible antimicrobial activities, 7 were selected, synthesized and in vitro tested against bacterial isolates. Synthetized peptides did not show antimicrobial activity when challenged by Gram-positive and Gram-negative bacteria. Thus, for this work, in silico prospecting, the metaproteomics associated with the prediction algorithms, has not been shown to be an effective method for the identification of antimicrobial peptides. In addition, for the second control strategy, aceturate has been shown to be synergistic with streptomycin and chloramphenicol against E. coli and K. pneumoniae isolated from humans and animals. Against S. aureus, otherwise, a synergistic effect was observed in combination with aceturate and chloramphenicol. These combinations of antimicrobials showed important results, demonstrating that this strategy can be used as an alternative at pathogens control.A resistência bacteriana consiste em uma das maiores ameaças à saúde no mundo, visto que reduz o tratamento efetivo de infecções e aumenta a mortalidade associada a doenças bacterianas comuns. Nesse contexto, a busca por estratégias para o controle de patógenos e da resistência antimicrobiana se faz necessária. Duas das estratégias desenvolvidas para combater esses microrganismos têm sido a terapia combinada de antimicrobianos e a prospecção de peptídeos antimicrobianos. No presente trabalho investigamos a efetividade in vitro de peptídeos prospectados do solo do Cerrado e a efetividade in vitro dos antimicrobianos aceturato de diminazeno, cloranfenicol e estreptomicina sozinhos e em combinação contra isolados clínicos de E. coli, K. pneumoniae e S. aureus. Para bioprospecção, o material foi coletado em solo nativo do Cerrado, as proteínas totais foram extraídas e os peptídeos identificados por LC-MS / MS foram analisados pelos algoritmos sense the moment e CAMP, a fim de prever peptídeos antimicrobianos. De todos os peptídeos com possível atividade antimicrobiana, 7 foram selecionados, sintetizados e testados in vitro como agentes antimicrobianos contra os isolados. Assim como, foi avaliada a atividade in vitro de aceturato de diminazeno, estreptomicina e cloranfenicol contra isolados de bactérias. Os peptídeos sintetizados não demostraram atividade antimicrobiana quando desafiados por bactérias Gram-positivas e Gram-negativas. Sendo assim, para este trabalho, a prospecção in silico, metaproteômica associada aos algoritmos de predição, não se demonstrou um método eficaz para a identificação de peptídeos antimicrobianos. Além disso, para a segunda estratégia de controle, o aceturato demonstrou ser sinérgico com a estreptomicina e o cloranfenicol contra E. coli e K. pneumoniae isoladas de humanos e animais. Contra S. aureus, por outro lado, o efeito sinérgico foi observado apenas na combinação de aceturato e cloranfenicol. Essas combinações de antimicrobianos apresentaram resultados importantes, demonstrando que essa estratégia pode ser utilizada como uma alternativa no controle de patógenos.