By using RAPD method, a total of 28 primers were screened for discrimination among Candida albicans isolates. Seven of these primers were selected because they presented reproducible DNA banding patterns for all the strains of C. albicans. The same genetic profile was obtained by RAPD method using OPG 14 (5’-GGATGAGACC-3’) while the OPG 17 (5’- ACGACCGACA-3’) demonstrated capacity to differentiate the isolates of C. albicans in 4 genotypes. According to the results obtained, we concluded that by using these primers, the RAPD analysis may be useful in providing genotypic characteristics for C. albicans in epidemiological investigation.Usando o método de amplificação randômica de DNA polimórfico (Randomly Amplified Polymorphic DNA analysis, RAPD), um total de 28 iniciadores (primers) foi estudado para discriminar entre os isolados de Candida albicans.Sete destes primers foram selecionados porque apresentaram padrões de banda de DNA reprodutíveis para todos os isolados de C. albicans. O mesmo perfil genético foi obtido usando OPG 14 (5’-GGATGAGACC-3’), enquanto o OPG 17 (5’-ACGACCGACA-3’) demonstrou capacidade de diferenciar os isolados em quatro genótipos. De acordo com os resultados obtidos, nós concluímos que usando estes primers, a análise de RAPD pode ser útil em prover características genotípicas em investigações epidemiológicas.