Vamos apresentar uma sequencia didática projetada na metodologia de aprendizagem ativa onde usamos a técnica da aprendizagem por projeto e Peer Instruction. Vamos apresentar a construção de uma modelagem matemática tendo como tema a implantação iônica de átomos metálicos em hospedeiros metálicos. Esta sequência será ministrada após as aulas sobre as aulas sobre ligações químicas. Nesta modelagem usaremos um potencial Leonard-Jones como base para a construção do modelo, de modo de que a cada etapa de construção do modelo e do simulador os estudantes vão discutindo a validade e os conceitos do modelo matemático. A sequência didática culmina em um simulador construído usando o software de Modellus.