Este estudo analisa os vários aspectos inerentes ao processo de financiamento da inovação em micro e pequenas empresas – MPEs, salientando o paradoxo do insucesso de muitos empreendimentos vinculado à falta de recursos e, por outro lado, a disponibilização de programas governamentais. O objetivo foi analisar os fatores condicionantes de acesso a esses recursos, tendo como caso de estudo a empresa Empório Amazônico Ltda., uma das aprovadas na primeira fase da Seleção Pública MCT/FINEP/Subvenção Econômica à Inovação de 2007. O trabalho constou de uma pesquisa qualitativa, por meio da estratégia de estudo de caso, com fontes de entrevistas semi-estruturadas e documentação. O tratamento, análise e interpretação das evidências foram realizados por meio da técnica de triangulação de dados. Os resultados indicaram que, apesar de ter havido um aumento significativo dos recursos totais, bem como aqueles destinados às MPEs, em relação ao ano anterior, os valores de projetos aprovados ainda ficaram abaixo do inicialmente previsto. A dificuldade de comunicação foi a principal questão levantada pelo estudo como um dos empecilhos para o acesso aos recursos governamentais, além de os entrevistados considerarem que o Programa de Subvenção Econômica ainda não contempla as empresas emergentes.