Artigo
Selection of Coffea arabica L. hybrids using mixed models with different structures of variance-covariance matrices
Seleção de híbridos de Coffea arabica L. por meio de modelos mistos com diferentes estruturas de matrizes de variância e covariância
Registro en:
PEREIRA, F. A. C. et al. Selection of Coffea arabica L. hybrids using mixed models with different structures of variance-covariance matrices. Coffee Science, Lavras, v. 13, n. 3, 2018.
Autor
Pereira, Fernanda Aparecida Castro
Carvalho, Samuel Pereira de
Rezende, Tiago Teruel
Oliveira, Leonardo Luiz
Maia, Diego Rosa Baquião
Institución
Resumen
This study aimed to evaluate different structures of variance-covariance matrices in modeling of productive
performance of coffee genotypes over the years, and select hybrids of Coffea arabica using mixed models. A mixed linear model
was used to estimate variance components, heritability coefficients, and prediction of genetic values of hybrids and cultivars.
Three commercial cultivars and eight hybrids of C. arabica L. were evaluated. The field production after acclimatization of
seedlings was conducted in March 2006. The yield averages from 2009, 2010, 2011, 2013, and 2014 agricultural years were
evaluated. The selection criteria of models were used to test 10 structures of variance-covariance matrices, and later a model
was chosen to estimate the components of variance, heritability coefficients, and prediction of genetic values. According to
Bayesian information criterion (BIC), the best structure was ARMA (Autoregressive Moving Average); however, considering
the Akaike Information Criterion (AIC) and corrected Akaike Information Criterion (AICC), the CSH (Heterogeneous
Composite Symmetric) was indicated. The Spearman correlation between the genotypic values obtained in the models with
ARMA and CSH type R matrix was 0.84. The high and positive correlation indicates that the best model could involve the
R matrix with ARMA or CSH structure. The heritability of individual genotypes differed from heritability in broad sense,
which considers the independence among agricultural years. Hybrids with higher performance were identified by ordering the
genotypic effects, among them, H 2.2, H 4.2, and H 6.1 hybrids were highlighted. Neste trabalho buscou-se avaliar diferentes estruturas de matrizes de variâncias e covariâncias na modelagem
do comportamento produtivo de genótipos de cafeeiro ao longo dos anos, e selecionar híbridos de Coffea arabica utilizando
um modelo linear misto Foram avaliadas três cultivares comerciais e oito híbridos de C. arabica L., utilizando mudas clonais
obtidas por meio do enraizamento de estacas caulinares de ramos ortotrópicos. O plantio em campo, após aclimatação das
mudas, foi realizado em março de 2006. Foram avaliadas as produções médias dos anos agrícolas 2009, 2010, 2011, 2013 e
2014. Critérios de seleção de modelos (RLL, AIC e BIC) foram utilizados para testar 10 estruturas da matriz R de variâncias
e covariâncias, e posteriormente selecionou-se um modelo para estimar os componentes de variância, os coeficientes de
herdabilidades e predição dos valores genéticos. Segundo o critério de informação Bayesiano (BIC) a melhor estrutura foi a
ARMA, porém considerando o critério de Akaike e Akaike corrigido, a CSH foi indicada. A correlação de Spearman entre os
valores genotípicos obtidos nos modelos com matriz R do tipo ARMA e CSH foi 0,84, alta e positiva, indicando que nesse
conjunto de dados o melhor modelo pode envolver a matriz R com estrutura ARMA ou CSH. A herdabilidade individual
dos genótipos foi diferente da herdabilidade no sentido amplo, que considera a independência entre os anos agrícolas. Pelo
ordenamento dos efeitos genotípicos foram identificados os híbridos de desempenho superior, dentre os quais destacaram os
híbridos H 2.2, H 4.2 e H 6.1.