A agricultura brasileira é um caso de sucesso em termos de inovação tecnológica, explicado, entre outros fatores, pela dinâmica construída entre organizações de pesquisa e atores do agronegócio, que caracterizam um ecossistema de inovação. O conceito de “agilidade” é central na competitividade e na esfera do gerenciamento de tais ecossistemas. A agilidade tem sido discutida como habilidade de adaptação para melhoria das capacidades de inovação de organizações em ambientes marcados por alta complexidade. Busca-se apresentar as definições e os conceitos de ecossistema de inovação e agilidade, bem como sua relação com os ambientes institucionais. A análise auxilia a compreensão dessa abordagem para a construção de políticas públicas e diretrizes para a gestão da inovação no setor agropecuário. Por ser elo importante no ecossistema de inovação no agronegócio, a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) será objeto de estudo. Resultados de avaliação experimental e exploratória são apresentados, demonstrando haver exemplos na busca de agilidade. Espera-se compreender melhor os desafios de repensar os processos de inovação no agronegócio brasileiro.46 p. : il.