Espécies nativas têm sido cada vez mais estudadas em função do seu potencial em reflorestar áreas degradadas. Nesse contexto, o presente estudo tem como objetivo avaliar o desenvolvimento inicial de duas espécies arbóreas nativas pioneiras, Cytharexyllum myrianthum Cham. (Pau-Viola) e Schinus terebinthifolius (Aroeira-Pimenteira), nos sistemas orgânico, convencional (NPK) e biodinâmico. Foram cultivadas por 6 meses, em cada um dos três substratos usados, 43 plantas de cada espécie. Foram medidas as características altura, diâmetro de colo, peso úmido e seco, e realizadas análises químicas das partes aérea e radicular das mudas. Os resultados mostraram que, em termos de crescimento, as espécies C. myrianthum e S. terebinthifolius apresentam respostas diferentes em relação aos substratos. De modo geral, C. myrianthum se desenvolve melhor em solo biodinâmico do que no orgânico, e melhor em solo orgânico do que com NPK. Já para S. terebinthifolius, embora a diferença entre os tratamentos não tenha sido evidente para várias características, há um melhor desempenho no solo com NPK do que no solo orgânico, e isso pode estar relacionado à ação química que atua diretamente na planta, mas que pode trazer grandes desvantagens em termos de conservação de solo. O estudo atende satisfatoriamente à proposta de buscar sistemas sustentáveis para o desenvolvimento de mudas e recuperação de áreas degradadas.Native species have been largely studied due to their potential for reforesting degradaded areas. In this way, the aim of the present study was to evaluate the initial development of two pioneer native tree species, Cytharexyllum myrianthum Cham. (Pau-Viola) and Schinus terebinthifolius (Aroeira-Pimenteira), in organic, conventional (NPK) and biodynamic soil. For 6 months 43 seedlings of each species were cultivated in each one of the tested soils. It were measured the plant height, colon diameter, wet and dry weight, and chemical analysis of aerial and root parts of the plants were carried as well. The results showed that the growth response of C. myrianthum was different from that of S. terebinthifolius. In general, C. myrianthum growths better in biodynamic than in organic soil, and better in organic than in conventional soil (NPK). For S. terebinthifolius, although the soil treatments almost did not affect of the tested characteristics, growth was still better in conventional than in organic soil, but it may be an effect of the chemical action of this treatment that has a direct effect on the plant and may bring serious soil conservation problems. The study satisfies the proposal of searching for sustained systems for the development of seedlings and recovery of degraded areas.