O objetivo deste trabalho foi avaliar alterações fisiológicas durante a ontogênese de sementes das pimentas malagueta e biquinho, e determinar o melhor estádio para colheita. As flores em antese foram etiquetadas diariamente e os frutos foram colhidos aos 25, 40, 55, 70, 85 e 100 dias após a antese (DAA). Em cada época de maturação, as sementes foram avaliadas quanto a: teor de água, massa de matéria seca, germinação, primeira contagem de germinação, índice de velocidade de germinação e envelhecimento acelerado. O início do desenvolvimento das sementes foi caracterizado pelo acúmulo de matéria seca, e ocorreu até os 80 DAA, para pimenta malagueta, ou até os 70 DAA, para pimenta biquinho. Em sementes ortodoxas, como as da pimenteira, observa-se decréscimo no teor de água após elas atingirem máxima matéria seca. Aos 100 DAA, o teor de água foi de 14%, na pimenta malagueta, e de 15%, na pimenta biquinho. As sementes colhidas aos 25 e 40 DAA não germinaram. A percentagem de germinação aumentou entre os 40 e 70 DAA, e diminuiu a partir de então. A maturidade fisiológica das sementes de pimentas malagueta e biquinho ocorre aproximadamente aos 70 DAA, época ideal para colheita.The objective of this work to evaluate the physiological changes during seed ontogeny of ''malagueta'' and ''biquinho'' pepper, and to determine the best stage for harvest. Flowers in anthesis were tagged daily, and fruits were collected at 25, 40, 55, 70, 85, and 100 days after anthesis (DAA). In each maturation time, seeds were evaluated for water content, dry weight, germination, first germination count, germination speed index, and accelerated aging. The beginning of seed development was characterized by dry matter accumulation, which occurred until 80 DAA for ''malagueta'' pepper and 70 DAA for ''biquinho'' pepper. In orthodox seeds, such as pepper, after reaching maximum dry matter, a decrease is observed in water content. At 100 DAA, water content was 14% for ''malagueta'' pepper and 15% for ''biquinho'' pepper. Seeds harvested at 25 and 40 DAA did not germinate. Germination percentage increased between 40 and 70 DAA, and decreased thereafter. Physiological maturity of ''malagueta'' and ''biquinho'' peppers occurs at approximately 70 DAA, which is the ideal time for harvest.