Hydribization screening of very short PCR products for paleoepidemiological studies of Chagas' disease

Cribado de hibridación de productos PCR muy cortos para estudios paleoepidemiológicos de la enfermedad de Chagas

dc.contributormmadden@d.umn.edu
dc.contributorFornaciari, Gino https://orcid.org/0000-0002-1334-1707
dc.contributorVallejo, Gustavo Adolfo https://orcid.org/0000-0002-9701-9140
dc.contributorJaramillo, Carlos https://orcid.org/0000-0003-1046-7256
dc.contributorGuhl, Felipe https://orcid.org/0000-0001-7180-7125
dc.creatorMadden, M
dc.creatorSalo, WL
dc.creatorStreitz, J
dc.creatorAufderheide, AC
dc.creatorFornaciari, G
dc.creatorJaramillo, C
dc.creatorVallejo, GA
dc.creatorYockteng, R
dc.creatorArriaza, B
dc.creatorCardenas-Arroyo, F
dc.creatorGuhl, F
dc.date2023-04-18T01:55:08Z
dc.date2023-04-18T01:55:08Z
dc.date2001
dc.date.accessioned2023-09-27T20:19:46Z
dc.date.available2023-09-27T20:19:46Z
dc.identifier0736-6205
dc.identifierhttps://repositorio.uta.cl/xmlui/handle/20.500.14396/2733
dc.identifier1940-9818
dc.identifier10.2144/01301st07
dc.identifier392GW
dc.identifier11196299
dc.identifierWOS:000166404200015
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8943258
dc.descriptionSingle strands of very short PCR products can be covalently immobilized to a slide and then easily detected by probe hyhridization. In this work, the PCR product was a 70-nucleotide segment of ancient DNA, representing a portion of repeat Trycircle, DNA from the kinetoplast of Trypanosoma cruzi, the infectious agent of Chagas' disease (American Trypanosomiasis). The target segment was initially established to be present in soft tissue samples taken from four naturally mummified Andean bodies using PCR followed by cloning and sequencing. Hybridization screening of the covalently immobilized PCR products posirivelv identified products from 25 of 27 specimens of different tissues from these four,mummies. The method appears to be ideal for the purpose of screening a large number of specimens when the target PCR product is very short.
dc.descriptionLas hebras simples de productos de PCR muy cortos pueden inmovilizarse covalentemente en un portaobjetos y luego detectarse fácilmente mediante la hibridación de la sonda. En este trabajo, el producto de PCR fue un segmento de 70 nucleótidos de ADN antiguo, que representa una porción de Trycircle repetido, ADN del cinetoplasto de Trypanosoma cruzi, el agente infeccioso de la enfermedad de Chagas (tripanosomiasis americana). Inicialmente, se estableció que el segmento objetivo estaba presente en muestras de tejido blando tomadas de cuatro cuerpos andinos momificados naturalmente mediante PCR seguido de clonación y secuenciación. La selección de hibridación de los productos de PCR inmovilizados covalentemente identificó productos de 25 de 27 especímenes de diferentes tejidos de estas cuatro momias. El método parece ser ideal para el cribado de un gran número de muestras cuando el producto de PCR objetivo es muy corto.
dc.formatapplication/pdf
dc.format5 páginas
dc.languageEnglish
dc.publisherFUTURE SCI LTD
dc.relationBiotechniques, vol.30 no.1 (2001) p. 102 - +
dc.relationhttps://doi.org/10.2144/01301st07
dc.rightsGreen Submitted, gold
dc.rightsAcceso abierto
dc.sourceBiotechniques
dc.subjectNorthern Chile
dc.subjectDna
dc.subjectNorte de Chile
dc.subjectAdn
dc.titleHydribization screening of very short PCR products for paleoepidemiological studies of Chagas' disease
dc.titleCribado de hibridación de productos PCR muy cortos para estudios paleoepidemiológicos de la enfermedad de Chagas
dc.typeArtículo de revista


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