Artículo de revista
Chloroplast genome of Tillandsia landbeckii Phil. (Bromeliaceae) a species adapted to the hyper-arid conditions of the Atacama and Peruvian desert
Genoma del cloroplasto de Tillandsia landbeckii Phil. (Bromeliaceae) una especie adaptada a las condiciones hiperáridas del desierto de Atacama y Perú
Registro en:
2380-2359
10.1080/23802359.2021.1997122
WU7OY
34778557
WOS:000716731900001
Autor
Cesar Chavez-Galarza, Julio
Cardenas-Ninasivincha, Steffany
Contreras, Roberto
Ferro-Mauricio, Ruben
Huanca-Mamani, Wilson
Institución
Resumen
Tillandsia landbeckii Phil. is a vulnerable species belonging to the terrestrial Bromeliaceae family; it is highly adapted to extremely hyper-arid conditions of the Atacama Desert and Peruvian deserts. In this study, we sequenced, assembled, and annotated its chloroplast genome. T. landbeckii chloroplast genome is 159,131 bp in length, containing a large single-copy region of 87,164 bp, a small single-copy region of 18,521 bp, and a pair of inverted repeat regions of 26,723 bp. The GC content of the chloroplast genome is 37.33%. It encodes a total of 132 genes, including 86 protein-coding genes, 38 tRNA genes and 8 rRNA genes. The phylogenetic tree indicates that T. landbeckii is placed within the Bromeliaceae family and has a close relationship with T. marconae with 100% support. Tillandsia landbeckii Phil. es una especie vulnerable perteneciente a la familia terrestre de las Bromeliaceae; está altamente adaptado a las condiciones extremadamente hiperáridas del desierto de Atacama y los desiertos peruanos. En este estudio, secuenciamos, ensamblamos y anotamos su genoma de cloroplasto. El genoma del cloroplasto de T. landbeckii tiene una longitud de 159 131 pb y contiene una región grande de copia única de 87 164 pb, una región pequeña de copia única de 18 521 pb y un par de regiones repetidas invertidas de 26 723 pb. El contenido de GC del genoma del cloroplasto es del 37,33%. Codifica un total de 132 genes, incluidos 86 genes que codifican proteínas, 38 genes de ARNt y 8 genes de ARNr. El árbol filogenético indica que T. landbeckii se ubica dentro de la familia Bromeliaceae y tiene una estrecha relación con T. marconae con un 100% de respaldo.