Artículo de revista
Deep Sequencing of RNA from Ancient Maize Kernels
Secuenciación profunda de ARN de granos de maíz antiguos
Registro en:
1932-6203
10.1371/journal.pone.0050961
086RY
2332631+
WOS:000314705800008
Autor
Fordyce, Sarah L.
Avila-Arcos, Maria C.
Rasmussen, Morten
Cappellini, Enrico
Romero-Navarro, J. Alberto
Wales, Nathan
Alquezar-Planas, David E.
Penfield, Steven
Brown, Terence A.
Vielle-Calzada, Jean-Philippe
Montiel, Rafael
Jorgensen, Tina
Odegaard, Nancy
Jacobs, Michael
Arriaza, Bernardo
Higham, Thomas F. G.
Ramsey, Christopher Bronk
Willersiev, Eske
Gilbert, M. Thomas P.
Institución
Resumen
The characterization of biomolecules from ancient samples can shed otherwise unobtainable insights into the past. Despite the fundamental role of transcriptomal change in evolution, the potential of ancient RNA remains unexploited - perhaps due to dogma associated with the fragility of RNA. We hypothesize that seeds offer a plausible refuge for long-term RNA survival, due to the fundamental role of RNA during seed germination. Using RNA-Seq on cDNA synthesized from nucleic acid extracts, we validate this hypothesis through demonstration of partial transcriptomal recovery from two sources of ancient maize kernels. The results suggest that ancient seed transcriptomics may offer a powerful new tool with which to study plant domestication. La caracterización de biomoléculas a partir de muestras antiguas puede arrojar información sobre el pasado que de otro modo no se podría obtener. A pesar del papel fundamental del cambio transcriptómico en la evolución, el potencial del ARN antiguo permanece sin explotar, quizás debido al dogma asociado con la fragilidad del ARN. Presumimos que las semillas ofrecen un refugio plausible para la supervivencia del ARN a largo plazo, debido al papel fundamental del ARN durante la germinación de las semillas. Usando RNA-Seq en cDNA sintetizado a partir de extractos de ácido nucleico, validamos esta hipótesis a través de la demostración de la recuperación transcriptómica parcial de dos fuentes de granos de maíz antiguos. Los resultados sugieren que la transcriptómica de semillas antiguas puede ofrecer una nueva y poderosa herramienta para estudiar la domesticación de plantas.