In agro-commercial activities, agricultural exports commodities, including soybeans and their byproducts, supply global markets to meet demands of the agribusiness, agri-food and agroenergy sectors, so transportation logistics physically interconnects the producing areas and consumer markets. This article aims to analyze the spatialization of transport logistics that articulates soybean flow exports, in a territorial configuration that encompasses the routing between Brazil and international markets, from 1997 to 2016. It was adopted as methodology, literature review, collection and analysis of secondary data, made available by Brazilian institutions and foreign institutes. Soybean and soy products export flows sector were concentrated in the Asian and European markets, which are interconnected by the national road, rail and waterway transport matrix, with concentration of products in port customs and maritime transport in international routes.Nas atividades agrocomerciais, as exportações de commodities agrícolas, incluindo a soja e seus derivados, abastecem os mercados globais no atendimento das demandas do setor agroindustrial, agroalimentício e agroenergético, por isso a logística de transportes interconecta fisicamente as áreas produtoras e os mercados consumidores. O objetivo deste artigo é analisar a espacialização da logística de transportes que articula o escoamento das exportações do setor de soja, em uma configuração territorial que engloba a roteirização entre o Brasil e os mercados internacionais, no período de 1997 a 2016. Adotou-se como metodologia a revisão de literatura, coleta e análise de dados secundários, disponibilizados pelas instituições brasileiras e pelos institutos estrangeiros. Os fluxos das exportações do setor de soja e de seus derivados concentraram-se nos mercados asiáticos e europeus, que são interligados pela matriz de transporte nacional rodoviária, ferroviária e hidroviária, com concentração dos produtos nos recintos alfandegados portuários e no transporte marítimo em percursos internacionais.