Ascídias são invertebrados marinhos cobertos por manto ligado a túnica que circunda o corpo. Esta contém α-L-galactana sulfatada enquanto que no corpo de algumas espécies reporta-se a presença de glicosaminoglicanos (GAG), denominados dermatam sulfato (DS) e heparina. Os DS de ascídias contém mesmo padrão estrutural que de mamífero. Todavia, possuem alto teor de ácido idurônico 2-sulfatado e diferem no padrão de sulfatação da N-acetilgalactosamina. Enquanto em mamíferos o padrão é α-UA-13-GalNAc(4SO 4 ), nas ascídias Styela plicata e Halocynthia piriformis é α-UA(2SO 4 )-13-GalNAc(4SO 4 ) e Phallusia nigra é α-UA(2SO 4 )-13-GalNAc(6SO 4 ). Estas diferenças estruturais produzem efeitos sobre as atividades anticoagulante e antitrombótica provocada por estes polímeros. Sendo assim, a utilização dessa classe de compostos, na condição de moléculas-modelo se faz importante para a melhor compreensão do mecanismo molecular em que estão envolvidos. O presente estudo visou a identificação e localização de GAGs presentes na ascídia Microcosmus exasperatus. Inicialmente, o corpo foi separado da túnica, e os GAGs foram extraídos por digestão proteolítica e precipitados em concentrações crescentes de etanol para posterior analise em eletroforese em gel de agarose e cromatografia. As precipitações iniciais demonstraram a presença de DNA e dois polissacarídeos sulfatados que precipitam em concentrações mais elevadas de etanol migraram como DS e heparina. A fim de localizar estes polissacarídeos sulfatados tecidos da ascídia foram corados com alcian blue e os resultados sugerem fortemente a presença destes polímeros. A elucidação desses compostos será importante para identificar requisitos estruturais essenciais para as atividades biológicas.