A otimização do Banco de Dados da Coleção de Culturas de Fungos de Referência do Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde usando o software Microsoft Access 2000, teve a finalidade de conferir segurança no tratamento dos dados, além de melhorar a rastreabilidade através dos relacionamentos e integração de outros bancos de dados. Assim, a otimização desta ferramenta na busca da conformidade dentro das normas da qualidade, garante o controle e o armazenamento dos dados. O banco de dados existente foi usado como base, sofrendo modificações em seus relacionamentos e todos os bancos de dados usados foram agregados e criados outros bancos, passando a ser um Sistema de Gerenciamento de Banco de Dados Relacional. Foi feito um estudo da Norma ABNT NBR ISO/IEC 17025:2005 em paralelo com os recursos que o sistema pode proporcionar, para utilização deste novo Banco de Dados da Coleção de Culturas de Fungos de Referência do INCQS no controle de estoque, produção, documentação e este foi utilizado como uma ferramenta de gerenciamento de dados do Setor de Fungos de Referência. O sistema também possibilitou gerar dados referentes às linhagens disponíveis para o portal do Instituto na Internet, além de criar um ambiente mais interativo para o usuário menos avançado.The Database optimization of the Reference Fungi Culture Collection of the National Institute of Quality Control in Health through Microsoft Access 2000 software, aims to provide security to data treatment, improve the tracing of data relationships, and integrate other data banks used on the Reference Fungi Sector. New data bases were created based on modifications and merges from existing data bases, originating a Relational Data Base Management System. The ABNT NBR ISO/IEC 17025:2005 Norm and Microsoft Access 2000’s resources provided the research base for the new Fungi Culture Collection Data Base of INCQS, currently used on stock control, production, documentation, and as a management tool for the Reference Fungi Sector. The data base was also able to provide data for the lineages available at the Institute’s Internet portal, as well as create a more interactive environment for the less advanced user.