Este artigo pretende problematizar as abordagens vigentes sobre a gênese da medicina tropical no Brasil, pondo em cena atores, conceitos e práticas médicas do período oitocentista, geralmente percebidos como antagônicos ao processo de institucionalização desse campo disciplinar. É nosso objetivo rever a rígida demarcação entre dois períodos pré-científico e científico no desenvolvimento da cultura médica no período imperial.This article aims at presenting the polemic current views on the genesis of tropical medicine in Brazil, by analyzing medical agents, concepts and procedures during the 18th century, which are generally understood as opposed to the institutionalization of this field of studies. It is our objective to revise the rigid boundaries between the pre-scientific and the scientific periods medical practice underwent during the Empire.