Since the relative success of vector control and transfusional transmission, congenital Chagas has became a concerning public health problem, and is an important route of transmission in endemic and non-endemic areas of Argentina. It is estimated that 5% of newbons from infected mothers are born infected. So far there is no way to prevent congenital transmission of Chagas. The treatment is contraindicated in pregnant women, but it is effective and well tolerated in the acute phase of infection in children and infants, with cure rates approaching 100%. Therefore it is very important to ensure the diagnosis and treatment of all children at risk of congenital transmission. With this objective, Argentina has adopted the antenatal screening for Chagas of all pregnant women and mandatory report through the National System of Health Surveillance (SNVS) of all pregnant women with Chagas and all newborns from positive mothers, to enable monitoring actions. Another system collecting information on pregnant women with Chagas is the Perinatal Information System (SIP). The aim of this study was to analyze the under-reporting of congenital Chagas disease in Argentina, in 2012, by capture-recapture methods (MCR), at national and regional level. The data source were three lists: two from the laboratory monitoring module (SIVILA) of SNVS (reports of positive pregnant women and reports newborns from positive mothers) and the third corresponding to positive pregnant women reported to SIP. The probabilistic linkaje of the data was performed and then MCR based on sample coverage approach were applied, in order to estimate the number of infants at risk of vertical transmission (TV) Chagas. The results showed there were born about 18,000 children at risk of vertical transmission of Chagas during the study period (01/01/2012 to 30/09/2012), which means only 1 in 5 pregnant women with Chagas and only 1 in 15 newborns positive mother were registered in the SIVILA-SNVS, with several differences among regions. The MCR were useful for the purpose of this study, however it is important to take care of the limitations of these methods to obtain reliable estimates.A partir del éxito relativo del control de la transmisión vectorial y transfusional, el chagas congénito se ha establecido como un problema de salud pública, siendo una importante vía de transmisión en zonas endémicas y no endémicas de la Argentina. Se estima que el 5 % de los hijos de madres positivas nacen con la infección. Hasta el momento no existe manera de prevenir la transmisión congénita de Chagas. El tratamiento en la embarazada está contraindicado, pero es efectivo y bien tolerado en niños y bebés en la fase aguda de la infección, con tasas de curación cercanas al 100%. Por ese motivo es de vital importancia garantizar el diagnóstico y tratamiento de todos los niños con riesgo de transmisión congénita. Con este objetivo, la Argentina ha adoptado el tamizaje prenatal para Chagas de todas las embarazadas y la notificación obligatoria a través del Sistema Nacional de Vigilancia de la Salud (SNVS) de todas las embarazadas con Chagas y de todos los niños hijos de madre positiva, para posibilitar las acciones de seguimiento. Otro sistema que recopila información sobre las embarazadas con Chagas es el Sistema Informático Perinatal (SIP). El objetivo de este trabajo fue analizar el subregistro de notificación de Chagas congénito en la Argentina, durante 2012, a través de métodos de captura y recaptura (MCR), a nivel nacional y regional. Para ello se utilizaron tres fuentes de datos: dos de ella provenientes del módulo de Vigilancia por laboratorio (SIVILA) del SNVS, la base de notificación de embarazadas positivas para Chagas y la base de recién nacidos de madres con Chagas y la tercera correspondiente a las mujeres con Chagas notificadas al SIP. Se realizó el relacionamiento probabilístico de los datos y luego se aplicaron MCR basados en el enfoque de cobertura de la muestra para la estimación del número de recién nacidos con riesgo de transmisión vertical (TV) de Chagas. Los resultados indican que para el periodo de estudio (01/01/2012 al 30/09/2012) nacieron aproximadamente 18000 niños con riesgo de transmisión vertical, lo que significa que sólo 1 cada 5 embarazadas con Chagas y sólo 1 de cada 15 recién nacidos de madre positiva fueron registrados en SIVILA-SNVS, con marcadas diferencias regionales, Los MCR resultaron útiles para el objetivo de este estudio, sin embargo es importante prestar atención a las limitaciones de estos métodos para la obtención de estimaciones confiables.