Este trabalho tem como objeto o estudo do financiamento federal na atenção à saúde e na saúde pública, no período entre 1995 e 2000. Aborda o papel do governo federal no financiamento das políticas do setor e o padrão de financiamento adotado para a implementação do Sistema Único de Saúde. É analisado o desempenho de cada uma das fontes de recursos para o financiamento do Ministério de Saúde. É analisada a flutuação das fontes ao longo da década de 1990 e demonstrado que o volume de recursos destinados ao setor não sofreu reduções significativas. O trabalho revela que o período foi marcado pelo conflito entre as orientações para a vinculação e para a desvinculação de fontes para o financiamento do setor.This study aims at analyzing the federal funding of public health care in the period between the years 1995 and 2000. It approaches the role of Brazilian federal government in financing health policies and the kind of financing used to implement SUS-- the Unified Health System/ Sistema Único de Saúde. The performance of each of the sources of funds to finance the activities of the Ministry of Health is analyzed. Attention is paid to the fluctuation of funding sources during the decade (1990s), demonstrating that the volume of sources destined to the area did not suffer any significant decrease. The findings of this study reveal that the period was characterized by a struggle between conflicting orientations regarding whether or not earmarking sources for financing the health sector.