Child development in welfare institutions is an area of study that has become relevant in recent years. However, little has been said about what the developmental trajectories of institutionalized children look like and how they are associated with institutional characteristics. Thus, the present study used data collected in four welfare institutions of Bogotá, Colombia, to describe the trajectories of cognitive and socio-emotional development in a group of 127 children over a ten-month period, with three moments of measurement. Multilevel analysis models were implemented to explore trajectories of change in the child development with three levels of nesting: within-subject, between-subject and between-group. The results show problems in the initial state of children's development, but their upward trajectories suggest a gradual improvement over time. The quality of care in welfare institutions, especially in terms of the interaction between caregivers and children, is a significant predictor of change in cognitive and socio-emotional development over time.El desarrollo infantil en instituciones de protección es un área de estudio que ha cobrado relevancia en los últimos años. No obstante, poco se ha dicho sobre cómo son las trayectorias del desarrollo de los niños institucionalizados y cómo estas se asocian a las características institucionales. De esta manera, el presente estudio usó datos recolectados en cuatro instituciones de protección en Bogotá, Colombia, para describir las trayectorias del desarrollo cognitivo y socioemocional en un grupo de 127 niños durante un periodo de diez meses, con tres momentos de medición. Se implementaron modelos de análisis multinivel para explorar las trayectorias de cambio en el desarrollo con tres niveles de anidación: intra-sujeto, entre-sujeto y entre-grupos. Los resultados muestran problemas en el estado inicial del desarrollo de los niños, pero sus trayectorias ascendentes sugieren una mejora paulatina en el tiempo. La calidad del cuidado de las instituciones, en especial las referidas a la interacción entre cuidadoras y niños, son un predictor significativo del cambio en el desarrollo cognitivo y socioemocional en el tiempo.